More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1153 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  60.74 
 
 
254 aa  315  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1443  ABC transporter related  50.41 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.605121 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0478  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
245 aa  251  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13650  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.56 
 
 
255 aa  226  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  44.31 
 
 
250 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  45.97 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
267 aa  221  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0393  ABC transporter related  44.09 
 
 
281 aa  216  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  42.4 
 
 
254 aa  208  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
244 aa  208  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  41.94 
 
 
255 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
262 aa  208  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  40.42 
 
 
260 aa  207  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  41.53 
 
 
255 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 
254 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 
254 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
254 aa  201  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
249 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
254 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
249 aa  198  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
249 aa  195  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  46.19 
 
 
254 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  42.21 
 
 
249 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  41.85 
 
 
260 aa  192  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  41.84 
 
 
270 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  42.21 
 
 
270 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 
254 aa  188  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 
249 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 
249 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 
249 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 
249 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 
229 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  39.26 
 
 
249 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 
249 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  38.71 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  44.76 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  39.26 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  42.25 
 
 
262 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  37.77 
 
 
286 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
249 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
249 aa  178  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
259 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  40.69 
 
 
257 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  38.31 
 
 
263 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  42.92 
 
 
223 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  37.34 
 
 
286 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  38.22 
 
 
259 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
263 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  36.65 
 
 
257 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  37.18 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  39.56 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  33.47 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  36.14 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  35.77 
 
 
273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  35.77 
 
 
273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  35.77 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  36.1 
 
 
257 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  37.75 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  35.83 
 
 
244 aa  171  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  36.8 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  36.8 
 
 
259 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  36.59 
 
 
279 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  42.13 
 
 
257 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 
265 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  36.63 
 
 
306 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  36.94 
 
 
257 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  38.78 
 
 
304 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  38.67 
 
 
270 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  34.78 
 
 
267 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  38.67 
 
 
270 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  38.57 
 
 
276 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  38.15 
 
 
254 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  35.32 
 
 
258 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  33.33 
 
 
257 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  35.08 
 
 
261 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  36.05 
 
 
259 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.52 
 
 
258 aa  169  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  36.25 
 
 
261 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  36.4 
 
 
259 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.49 
 
 
257 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  36.55 
 
 
292 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  38.55 
 
 
254 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  34.57 
 
 
265 aa  168  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  38.81 
 
 
263 aa  168  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
261 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  35.06 
 
 
259 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>