More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0744 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0744  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0720  ABC transporter related  93.48 
 
 
230 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1146  ABC transporter related  48.26 
 
 
237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318577  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  47.72 
 
 
218 aa  207  9e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0243  ABC transporter related  43.17 
 
 
240 aa  206  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.498468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0339  putative sulfonate transport system ATP-binding protein  44.98 
 
 
231 aa  205  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1866  ABC transporter related  44.02 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
232 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 
251 aa  175  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0452  ABC transporter related  39.48 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0437  ABC transporter related  39.48 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  41.82 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0518  ABC transporter related  40.17 
 
 
251 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0668651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
261 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  40.59 
 
 
228 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  39.46 
 
 
281 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  40 
 
 
271 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 
263 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.79 
 
 
274 aa  167  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  41.5 
 
 
251 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.38 
 
 
245 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  43.81 
 
 
267 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  41.78 
 
 
243 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.19 
 
 
251 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  40.17 
 
 
289 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  41.5 
 
 
251 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  41.58 
 
 
267 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43 
 
 
286 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  39.51 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  44.56 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
251 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  41.13 
 
 
237 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 
251 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  40.26 
 
 
287 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 
251 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  40.45 
 
 
271 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  40.67 
 
 
251 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 
262 aa  165  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 
287 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  41.09 
 
 
267 aa  165  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  36.28 
 
 
265 aa  165  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  37.29 
 
 
245 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  40.78 
 
 
266 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  38.81 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  45 
 
 
333 aa  164  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  44 
 
 
262 aa  164  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  44.86 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  38.79 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  39.02 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  35.9 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  39.02 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 
273 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  38.64 
 
 
264 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  39.74 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  39.74 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  39.04 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  41.21 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  41.83 
 
 
264 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
284 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  42.65 
 
 
291 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  41.75 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  39.73 
 
 
286 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  40.45 
 
 
263 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  43.94 
 
 
254 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  42.5 
 
 
258 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  40.45 
 
 
261 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  40 
 
 
278 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 
259 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  43.94 
 
 
254 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  40.67 
 
 
266 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  43.94 
 
 
254 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.1 
 
 
258 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  41.06 
 
 
272 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  40.48 
 
 
268 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  43.5 
 
 
278 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  41.74 
 
 
268 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  41.36 
 
 
266 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  37.22 
 
 
267 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  38.21 
 
 
272 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  36.07 
 
 
267 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
254 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.74 
 
 
258 aa  159  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  42.11 
 
 
246 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  38.18 
 
 
259 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  40.91 
 
 
255 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  38.11 
 
 
246 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  40.69 
 
 
265 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  38.39 
 
 
261 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  37.79 
 
 
250 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  40.69 
 
 
265 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 
249 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  40.93 
 
 
269 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 
249 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
254 aa  158  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0014  ABC transporter related  39.15 
 
 
235 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.91 
 
 
276 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  39.09 
 
 
272 aa  158  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  43.94 
 
 
257 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>