More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1866 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1866  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  59.16 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2850  ABC transporter related  47.18 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  44.09 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  39.04 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  43.64 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 261 aa  179  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  40.68 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  43.18 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  41.36 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  44.39 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  40.25 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  40.25 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  42.36 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.15 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  44.24 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  43.33 
 
 		 251 aa  177  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 267 aa  177  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.33 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  40.85 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  43.91 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  40.68 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  40.99 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  41.23 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  40.93 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  40.93 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.75 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  41.35 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.71 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  44.86 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  43.42 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  43.48 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  42.24 
 
 		 278 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  41.53 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  40.08 
 
 		 286 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  42.99 
 
 		 276 aa  174  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  40.64 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  42.06 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  42.47 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  40.62 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  39.27 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  40.76 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  39.92 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.42 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  41.7 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0014  ABC transporter related  46.19 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1760  ABC transporter related  40.08 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  39.91 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  44 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2144  ABC transporter related  40.08 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  41.75 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  44.74 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 		 273 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.42 
 
 		 270 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  42.22 
 
 		 286 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  43.33 
 
 		 287 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  40.55 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  42.86 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.4 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  40.16 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  41.83 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  40.65 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  41.51 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  41.1 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  40.27 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  39.83 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  39.5 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0518  ABC transporter related  42.03 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0668651 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.22 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  41.63 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  39.24 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  43.2 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 440 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  38.97 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  42.66 
 
 		 326 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  42.61 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  40.79 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  45.07 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3784  ABC transporter related  38.82 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15686 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  44.44 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  44.44 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  41.44 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>