More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1930 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 262 aa  540  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1866  ABC transporter related  59.16 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2850  ABC transporter related  42.21 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  41.49 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  40.23 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0014  ABC transporter related  41.7 
 
 		 235 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.47 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  38.96 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  41.6 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  41.63 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  43.48 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  40.69 
 
 		 291 aa  175  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  41.53 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  39.08 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  38.27 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  36.51 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  42.37 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  38.52 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  37.6 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  40.09 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  39.66 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  41.03 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.84 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  37.5 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  39.83 
 
 		 288 aa  171  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  41.03 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  42.08 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  40.34 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  41.23 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  42.37 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  39.06 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  40.55 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  42.39 
 
 		 294 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  42.08 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  39.56 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  41.18 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  39.67 
 
 		 281 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  41.32 
 
 		 258 aa  168  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.98 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  37.11 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  40.08 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.55 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 		 281 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  37.34 
 
 		 288 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  40.77 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  40.41 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  42.92 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  40 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.66 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  41.47 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  37.3 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.75 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  42.04 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  41.81 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0518  ABC transporter related  38.29 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0668651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  39.3 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  39.32 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  41.03 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  39.69 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  40.33 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  36.11 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  36.11 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  36.11 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  41.44 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  42.08 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  40.72 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.04 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.19 
 
 		 668 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  40.57 
 
 		 249 aa  165  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  40.17 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  42.67 
 
 		 245 aa  165  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.15 
 
 		 673 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40 
 
 		 663 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2266  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.27 
 
 		 587 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.278164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0290  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  38.43 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0927  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.25 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941712  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.52 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  38.75 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  39.53 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  37.82 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>