More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5421 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  100 
 
 		 294 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  73.54 
 
 		 262 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  65 
 
 		 261 aa  342  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  65.86 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  62.2 
 
 		 260 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  58.37 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  58.37 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  57.85 
 
 		 259 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  54.37 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  55.12 
 
 		 290 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  55.69 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3541  ABC transporter related  44.53 
 
 		 255 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774244  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.21 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.03 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.83 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  48.72 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.25 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.25 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.25 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  44.3 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.6 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.67 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  44.62 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  45.49 
 
 		 303 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  44.8 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.8 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  46.89 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  48.03 
 
 		 288 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.02 
 
 		 264 aa  208  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.48 
 
 		 668 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.48 
 
 		 668 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.48 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.67 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.61 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.23 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7248  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 222 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00375076  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  44 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  50.67 
 
 		 274 aa  206  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  44.66 
 
 		 278 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  44.18 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.48 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.08 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.3 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.19 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50 
 
 		 279 aa  202  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  47.89 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  45.33 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  47.01 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.25 
 
 		 659 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.16 
 
 		 258 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  45.33 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.05 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  50.23 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.38 
 
 		 669 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.2 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.23 
 
 		 258 aa  200  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 		 261 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  45.37 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.81 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.41 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.15 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2323  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.39 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  49.77 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.87 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  45.9 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.54 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.72 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  43.89 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.1 
 
 		 260 aa  199  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  39.25 
 
 		 278 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  45.37 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.35 
 
 		 668 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.49 
 
 		 264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.44 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  42.91 
 
 		 282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  44.31 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.73 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.57 
 
 		 673 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  50.7 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.8 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.4 
 
 		 251 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001609  nitrate ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.6 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.08 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  42.86 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.11 
 
 		 657 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.87 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0156  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.03 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  47.41 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  39.38 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.66 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  44.08 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>