More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0518 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0518  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  519  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0668651 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0156  ABC transporter related protein  58.26 
 
 
250 aa  316  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.95 
 
 
274 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  38.71 
 
 
267 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 
271 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.39 
 
 
253 aa  216  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  42.15 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  40.32 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  41.85 
 
 
271 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  41.85 
 
 
271 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.15 
 
 
267 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  46.29 
 
 
260 aa  214  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.68 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  41.8 
 
 
252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  40.08 
 
 
275 aa  211  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  39.53 
 
 
286 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  41.81 
 
 
291 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
278 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  38.93 
 
 
263 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  40.82 
 
 
306 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  45.27 
 
 
271 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  42.68 
 
 
274 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  44.77 
 
 
268 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  43.11 
 
 
275 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 
262 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.66 
 
 
254 aa  208  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
261 aa  208  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  42.32 
 
 
256 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  44.83 
 
 
271 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  40.82 
 
 
303 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  40.82 
 
 
303 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  40.82 
 
 
303 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
438 aa  206  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 
434 aa  206  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.44 
 
 
251 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  39.67 
 
 
289 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  38.31 
 
 
267 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
254 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
267 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  40.82 
 
 
304 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  40 
 
 
304 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.22 
 
 
304 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  38.68 
 
 
254 aa  205  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  37.86 
 
 
272 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
264 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  41.05 
 
 
278 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  39.09 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  43.15 
 
 
273 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
308 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  44.89 
 
 
265 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  42.29 
 
 
253 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.86 
 
 
283 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  41.92 
 
 
280 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  42.74 
 
 
266 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  42.74 
 
 
266 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  39.47 
 
 
287 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.6 
 
 
275 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  39.91 
 
 
293 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.17 
 
 
254 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  43.15 
 
 
273 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
252 aa  203  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  43.15 
 
 
273 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  39.91 
 
 
293 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  40.57 
 
 
261 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  43.67 
 
 
262 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
260 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  42.74 
 
 
271 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  38.91 
 
 
256 aa  201  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3947  ABC transporter related  42.62 
 
 
262 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.193949 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  40.76 
 
 
260 aa  201  9e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  40.89 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.98 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  41.15 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  41.15 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.34 
 
 
276 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  41.06 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  40.57 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
261 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  42.68 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  43.15 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  39.75 
 
 
256 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
267 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  43.11 
 
 
268 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  39.69 
 
 
292 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  39.68 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  42.01 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  42.01 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  38.4 
 
 
282 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  39.17 
 
 
263 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  39.43 
 
 
262 aa  198  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  38.15 
 
 
259 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  39.68 
 
 
265 aa  198  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 
273 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  41.74 
 
 
244 aa  198  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  38.63 
 
 
271 aa  197  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  43.83 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>