More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2014 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  100 
 
 
277 aa  564  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  69.17 
 
 
282 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  67.84 
 
 
284 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  58.59 
 
 
299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  58.98 
 
 
304 aa  305  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  58.98 
 
 
306 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  58.43 
 
 
276 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  54.72 
 
 
267 aa  281  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  53.15 
 
 
274 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 
267 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  54.76 
 
 
267 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  52.73 
 
 
266 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  53.16 
 
 
276 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  53.33 
 
 
266 aa  261  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  51.2 
 
 
274 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  54.92 
 
 
252 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  49.8 
 
 
252 aa  259  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.47 
 
 
276 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  53.31 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.44 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  53.17 
 
 
267 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  50.59 
 
 
269 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  52.4 
 
 
261 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  51.95 
 
 
270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  50.38 
 
 
271 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  49.03 
 
 
259 aa  225  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  50.62 
 
 
246 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  51.37 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  44.36 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  45.63 
 
 
246 aa  212  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  46.59 
 
 
274 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  46.59 
 
 
268 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  56.93 
 
 
284 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.74 
 
 
258 aa  209  5e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49.09 
 
 
289 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 
263 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  55.94 
 
 
289 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.72 
 
 
254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  45.74 
 
 
293 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.72 
 
 
254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  55.5 
 
 
284 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  45.74 
 
 
293 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
261 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
261 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.87 
 
 
260 aa  205  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  49.57 
 
 
264 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  47.68 
 
 
267 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
275 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.94 
 
 
254 aa  204  9e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  44.44 
 
 
262 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  44.61 
 
 
289 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.82 
 
 
330 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.16 
 
 
281 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.9 
 
 
254 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  46.47 
 
 
255 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  48.71 
 
 
278 aa  201  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.26 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  43.55 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  45.16 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  48.73 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  50.96 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  49.32 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  43.87 
 
 
278 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  48.46 
 
 
311 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  47.92 
 
 
257 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
260 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  46.38 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.87 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  50.23 
 
 
253 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.78 
 
 
287 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  49.58 
 
 
266 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  49.14 
 
 
278 aa  198  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  43.51 
 
 
261 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 
311 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  46.28 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  46.36 
 
 
266 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.98 
 
 
245 aa  198  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  40.08 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  49.78 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.16 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  49.55 
 
 
259 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  42.08 
 
 
275 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  42.53 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  49.11 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  46.58 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  46.58 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  43.48 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.03 
 
 
267 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  45.22 
 
 
276 aa  195  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 
261 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  41.77 
 
 
265 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  43.67 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.66 
 
 
274 aa  195  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  46.58 
 
 
252 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44 
 
 
274 aa  195  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>