More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5133 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  84.64 
 
 		 266 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  62.41 
 
 		 267 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  56.05 
 
 		 252 aa  301  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  59.13 
 
 		 269 aa  301  9e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  58.82 
 
 		 252 aa  299  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.29 
 
 		 276 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  58.89 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  56.09 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  59.2 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  57.94 
 
 		 268 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  57.47 
 
 		 259 aa  285  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  58.17 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  56.86 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  57.14 
 
 		 276 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  58.13 
 
 		 246 aa  281  9e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  57.77 
 
 		 271 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  57.71 
 
 		 270 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.64 
 
 		 324 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  57.47 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  54.03 
 
 		 284 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  52.73 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  52.4 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  52 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  54 
 
 		 284 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  52 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  52.52 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  50.6 
 
 		 246 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  46.04 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  49 
 
 		 274 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  47.08 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  50.6 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.46 
 
 		 258 aa  214  8e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  43.82 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  43.87 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  43.6 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  43.46 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.25 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  46.12 
 
 		 278 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  45.21 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.67 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.06 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  45.16 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  41.7 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.02 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  42.08 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  42.06 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  49.07 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  45.56 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  40.53 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  41.8 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  45.24 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.46 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 		 253 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.06 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.81 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  48.08 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.67 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  48.17 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  44.8 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  51.01 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  46.33 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.17 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.86 
 
 		 330 aa  198  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  43.93 
 
 		 269 aa  198  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  44.05 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  50.51 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  48.31 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.61 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  46.67 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  44.05 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  48.79 
 
 		 333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  41.77 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  43.44 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  42.8 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  41.13 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  44.54 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.63 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  42.86 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  45.69 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.17 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.43 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  42.63 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  46.55 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>