More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2589 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  100 
 
 		 284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  87.32 
 
 		 282 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  67.84 
 
 		 277 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  61.04 
 
 		 299 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  60.24 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  59.84 
 
 		 306 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  59.44 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  55.77 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  56.91 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  57.03 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  50.78 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  56.45 
 
 		 267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  54.62 
 
 		 266 aa  265  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  51.64 
 
 		 274 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.52 
 
 		 276 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  54.03 
 
 		 266 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  54.12 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.95 
 
 		 324 aa  262  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 267 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  51.87 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  51.98 
 
 		 269 aa  251  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  53.04 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  52.38 
 
 		 268 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  49.63 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  51.91 
 
 		 246 aa  244  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  53.17 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  49.6 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  50.2 
 
 		 271 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  53.09 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  51.22 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  49.57 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 261 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.91 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  47.9 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  49.36 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  49.39 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.72 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  49.14 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  46.42 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  45.56 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.15 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.12 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  46.98 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.9 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.64 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  48.72 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  47.68 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.12 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.48 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  46.15 
 
 		 266 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.86 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.98 
 
 		 260 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  45.06 
 
 		 269 aa  208  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  48.17 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  43.35 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.69 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.96 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.22 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  50.64 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  45.06 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.93 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  49.33 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.26 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.31 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  45.53 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  43.3 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.72 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  47.26 
 
 		 244 aa  205  8e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 		 289 aa  205  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  44.22 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  41.73 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  46.22 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  44.22 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  46.81 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.74 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  50.21 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  50.21 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  42.86 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.36 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  48.19 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.42 
 
 		 244 aa  201  9e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.15 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  41.41 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  44.96 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.35 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  44.62 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  48 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  44.59 
 
 		 272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>