More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1264 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  72.59 
 
 		 304 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  72.2 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  71.43 
 
 		 299 aa  371  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  59.68 
 
 		 276 aa  301  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  59.44 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  58.63 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  56.18 
 
 		 277 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  54.55 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  54.37 
 
 		 252 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  54.22 
 
 		 267 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  52.26 
 
 		 267 aa  262  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.85 
 
 		 276 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  52.61 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  52.99 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  54 
 
 		 266 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  53.52 
 
 		 266 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  54.29 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  49.24 
 
 		 274 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  52.94 
 
 		 270 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  50.2 
 
 		 267 aa  251  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  50.99 
 
 		 269 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  51.59 
 
 		 261 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  49.4 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.2 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  52.44 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  49.79 
 
 		 246 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  56.2 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.95 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  51.49 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  51.06 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  48.73 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  47.41 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  43.78 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  49.12 
 
 		 278 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.75 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.62 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  48.28 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  41.57 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  42.32 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  46.67 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  47.13 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.26 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  47.64 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  46.06 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  48.18 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.23 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  46.85 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  46.81 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49.33 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  42.97 
 
 		 284 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  49.17 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.74 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.19 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  48.89 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.7 
 
 		 330 aa  198  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  46.61 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  42.68 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.8 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.35 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  45.28 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  46.29 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  44.8 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  46.69 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  42.54 
 
 		 271 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  42.69 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  45.85 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.4 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  41.02 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  42.16 
 
 		 271 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.45 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  48.06 
 
 		 252 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  48.06 
 
 		 252 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  41.73 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  41.51 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  42.91 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  48.06 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.45 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  44.91 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  43.78 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  42.37 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  39.92 
 
 		 272 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  47.64 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  43.53 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  44.27 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.04 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  41.85 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  44.05 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>