More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0802 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  100 
 
 
434 aa  870    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  61.56 
 
 
436 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  61.56 
 
 
436 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  63.12 
 
 
439 aa  521  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  51.73 
 
 
458 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  47.77 
 
 
432 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
435 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  48.72 
 
 
435 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  45.75 
 
 
426 aa  361  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  44.55 
 
 
432 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  44.55 
 
 
432 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  46.54 
 
 
437 aa  359  7e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  46.63 
 
 
454 aa  354  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.81 
 
 
448 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  47.9 
 
 
445 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  46.81 
 
 
448 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
446 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
446 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  46.57 
 
 
446 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
446 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
446 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
446 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
446 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  46.57 
 
 
448 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  49.26 
 
 
437 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 
446 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  45.14 
 
 
440 aa  348  8e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  46.01 
 
 
437 aa  348  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  45.86 
 
 
445 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  45.86 
 
 
445 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.86 
 
 
445 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  45.86 
 
 
445 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  45.86 
 
 
445 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  45.86 
 
 
445 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  45.86 
 
 
450 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  45.86 
 
 
445 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  45.86 
 
 
448 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  44.99 
 
 
445 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  44.21 
 
 
441 aa  344  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  45.63 
 
 
453 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.52 
 
 
448 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  44.63 
 
 
433 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  44.63 
 
 
433 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  45.52 
 
 
448 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  45.52 
 
 
448 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  45.52 
 
 
448 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 
438 aa  339  7e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  44.19 
 
 
448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  43.98 
 
 
447 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.92 
 
 
446 aa  332  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  43.72 
 
 
435 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
434 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  42.45 
 
 
433 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  42.82 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  43.93 
 
 
448 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  41.11 
 
 
453 aa  322  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 
433 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  42.69 
 
 
457 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  42.82 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  42.92 
 
 
457 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 
449 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 
511 aa  310  4e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  43.39 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  41.65 
 
 
454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 
434 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
438 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  40.24 
 
 
457 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 
438 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  40.19 
 
 
436 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  40.19 
 
 
436 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  39.76 
 
 
447 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  42.64 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  51.68 
 
 
249 aa  265  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.77 
 
 
245 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  45.93 
 
 
244 aa  230  5e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  46.75 
 
 
244 aa  225  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  46.64 
 
 
244 aa  224  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  46.5 
 
 
244 aa  223  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.18 
 
 
263 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.25 
 
 
258 aa  217  4e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  42.75 
 
 
288 aa  216  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  42.86 
 
 
272 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.5 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 
271 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  44.81 
 
 
291 aa  213  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44.58 
 
 
267 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.61 
 
 
260 aa  213  7e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.86 
 
 
260 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  45.6 
 
 
259 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  43.6 
 
 
284 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  42.08 
 
 
304 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 
256 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  38.98 
 
 
267 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  45.38 
 
 
260 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.98 
 
 
253 aa  209  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  41.94 
 
 
261 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  39.53 
 
 
260 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  39.16 
 
 
273 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>