More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4139 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  89.56 
 
 		 448 aa  822    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 446 aa  850    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 446 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  99.55 
 
 		 448 aa  903    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  96.43 
 
 		 445 aa  876    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  96.65 
 
 		 448 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  92.63 
 
 		 446 aa  828    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  91.96 
 
 		 448 aa  839    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  96 
 
 		 450 aa  872    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  95.54 
 
 		 445 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  90 
 
 		 448 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 446 aa  850    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  97.77 
 
 		 448 aa  884    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  96.65 
 
 		 445 aa  877    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  97.77 
 
 		 448 aa  884    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 446 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  96.88 
 
 		 445 aa  879    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  100 
 
 		 453 aa  917    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  96.88 
 
 		 445 aa  879    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  97.77 
 
 		 448 aa  884    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 446 aa  850    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  96.88 
 
 		 445 aa  879    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 446 aa  850    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 446 aa  850    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  96.88 
 
 		 445 aa  879    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  64.41 
 
 		 447 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  63.15 
 
 		 441 aa  541  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  63.23 
 
 		 444 aa  538  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.76 
 
 		 446 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  61.89 
 
 		 448 aa  538  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  63.51 
 
 		 433 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  61.08 
 
 		 433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  63.44 
 
 		 435 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  60.85 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  62.12 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  62.8 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  60.9 
 
 		 435 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  60.66 
 
 		 435 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  61.65 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  58.41 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  58.41 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  54.77 
 
 		 453 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  56.32 
 
 		 437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  56.64 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  55.4 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  55.4 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  57.04 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  53.63 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  53.63 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  54.76 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  56.19 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  55.53 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  54.24 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  55.53 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  55.07 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  50.36 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  50.83 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  51.26 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  50.99 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  48.86 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  47 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  47.92 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  48.72 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  47.37 
 
 		 439 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  45.24 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  45.63 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  44.44 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 262 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 511 aa  300  4e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  56.15 
 
 		 249 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  38.95 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.29 
 
 		 244 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  77.64 
 
 		 211 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  49.14 
 
 		 244 aa  238  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  47.23 
 
 		 244 aa  232  1e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  47.01 
 
 		 244 aa  230  4e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  72.5 
 
 		 175 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.8 
 
 		 245 aa  226  6e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.48 
 
 		 252 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.43 
 
 		 258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.09 
 
 		 263 aa  220  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.31 
 
 		 263 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.27 
 
 		 259 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  46.36 
 
 		 264 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  41.49 
 
 		 257 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.27 
 
 		 260 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.09 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.58 
 
 		 269 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  46.72 
 
 		 257 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.14 
 
 		 288 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.15 
 
 		 297 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 264 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.1 
 
 		 259 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>