More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0998 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
446 aa  896    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  92.63 
 
 
448 aa  840    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  93.78 
 
 
450 aa  854    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  100 
 
 
446 aa  896    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  95.74 
 
 
445 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  91.74 
 
 
448 aa  833    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  99.33 
 
 
446 aa  892    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  95.96 
 
 
445 aa  862    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  91.29 
 
 
448 aa  832    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
446 aa  896    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  94.2 
 
 
448 aa  853    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  92.19 
 
 
448 aa  835    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  92.19 
 
 
448 aa  836    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  95.74 
 
 
445 aa  858    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  92.19 
 
 
448 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
446 aa  896    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  95.96 
 
 
445 aa  860    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
446 aa  896    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  93.75 
 
 
453 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  95.96 
 
 
445 aa  860    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  92.19 
 
 
448 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  95.96 
 
 
445 aa  860    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
446 aa  896    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  95.96 
 
 
445 aa  860    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
446 aa  896    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  62.7 
 
 
447 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  64.15 
 
 
433 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  63.7 
 
 
444 aa  541  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  61.54 
 
 
441 aa  541  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.23 
 
 
446 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  62.75 
 
 
448 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  61.79 
 
 
433 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 
435 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  61.85 
 
 
435 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  62.62 
 
 
439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  63.68 
 
 
435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  61.56 
 
 
433 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  62.03 
 
 
433 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  58.91 
 
 
437 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  61.56 
 
 
434 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  60.09 
 
 
436 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  60.09 
 
 
436 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  56.29 
 
 
453 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  57.52 
 
 
437 aa  477  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  56.57 
 
 
438 aa  471  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  58.22 
 
 
445 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  56.57 
 
 
434 aa  472  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  56.67 
 
 
445 aa  463  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  54.8 
 
 
432 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  54.8 
 
 
432 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 
454 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  58.25 
 
 
437 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  55.43 
 
 
438 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  55.43 
 
 
457 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  56.77 
 
 
447 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  54.99 
 
 
438 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  56.14 
 
 
447 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  50.84 
 
 
432 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  51.77 
 
 
448 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  51.38 
 
 
448 aa  405  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  50.23 
 
 
457 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  49.32 
 
 
457 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 
449 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  47.69 
 
 
458 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  50.49 
 
 
426 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
454 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  47.42 
 
 
440 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  48.48 
 
 
439 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  46.56 
 
 
439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  46.57 
 
 
434 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  45.94 
 
 
436 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  45.37 
 
 
436 aa  349  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  55.77 
 
 
262 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 
511 aa  296  4e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  39.34 
 
 
434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  55.74 
 
 
249 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  77.02 
 
 
211 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  47.44 
 
 
244 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  47.01 
 
 
244 aa  231  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  47.84 
 
 
244 aa  231  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  73.75 
 
 
175 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  46.81 
 
 
244 aa  229  7e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.64 
 
 
245 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.48 
 
 
252 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.03 
 
 
258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.52 
 
 
274 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.09 
 
 
263 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.06 
 
 
259 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.31 
 
 
263 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.27 
 
 
260 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.16 
 
 
257 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.42 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.92 
 
 
304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.58 
 
 
269 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 
253 aa  213  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 
259 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.02 
 
 
288 aa  212  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  45.12 
 
 
286 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.92 
 
 
304 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  41.74 
 
 
257 aa  212  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>