More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0693 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  100 
 
 		 441 aa  889    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  81.12 
 
 		 444 aa  709    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  67.21 
 
 		 446 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  66.59 
 
 		 447 aa  590  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  67.05 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  65.45 
 
 		 435 aa  569  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  65.37 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  65.12 
 
 		 433 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  65.5 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  63.15 
 
 		 448 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  61.43 
 
 		 450 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  62.91 
 
 		 448 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.91 
 
 		 448 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  63.15 
 
 		 453 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  62.91 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  63 
 
 		 433 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  61.43 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.91 
 
 		 445 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.91 
 
 		 448 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  62.68 
 
 		 446 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  62.91 
 
 		 445 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  62.68 
 
 		 445 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  63.15 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  62.91 
 
 		 445 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  62.91 
 
 		 445 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  63.15 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  62.91 
 
 		 445 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  63.15 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  61.59 
 
 		 439 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  58.8 
 
 		 435 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  59.4 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  58.97 
 
 		 437 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  57.56 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  53.4 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  55.27 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  53.4 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  55.27 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  56.03 
 
 		 437 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  52.46 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  52.46 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  56.56 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  55.63 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  53.05 
 
 		 454 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  54.89 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  52.57 
 
 		 457 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  54.37 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  53.88 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  47.82 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  46.89 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  47.06 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  49.88 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  50 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  50.74 
 
 		 449 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  46.1 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  67.05 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  46.7 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  44.6 
 
 		 436 aa  359  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  44.7 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  43.91 
 
 		 439 aa  345  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  44.21 
 
 		 434 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  40.27 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  56.18 
 
 		 511 aa  290  4e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  53.63 
 
 		 249 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  51.1 
 
 		 244 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  48.19 
 
 		 245 aa  237  3e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  67.72 
 
 		 211 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  46.7 
 
 		 244 aa  230  4e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  48.66 
 
 		 244 aa  229  9e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.97 
 
 		 244 aa  227  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.08 
 
 		 252 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  219  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.23 
 
 		 263 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.72 
 
 		 258 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  45.92 
 
 		 275 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.72 
 
 		 274 aa  213  7e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 281 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  65.03 
 
 		 175 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.53 
 
 		 297 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 256 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  43.6 
 
 		 267 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.03 
 
 		 254 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.03 
 
 		 254 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 		 261 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 261 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  41.57 
 
 		 263 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.58 
 
 		 304 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>