More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0136 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  867    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  867    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  65.41 
 
 
434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  65.41 
 
 
438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  61.97 
 
 
435 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  61.03 
 
 
435 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  56.18 
 
 
437 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  56.84 
 
 
445 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  56.84 
 
 
437 aa  478  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  54.78 
 
 
447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  54.19 
 
 
444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  56.61 
 
 
445 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  54.33 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  53.7 
 
 
448 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
446 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.69 
 
 
446 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
446 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  54.8 
 
 
446 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  54.33 
 
 
445 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  54.57 
 
 
445 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  54.57 
 
 
445 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  53.4 
 
 
433 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  54.33 
 
 
445 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  54.57 
 
 
445 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  54.8 
 
 
445 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  54.57 
 
 
445 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  54.33 
 
 
450 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
446 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
446 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
446 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
446 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
446 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  54.1 
 
 
448 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.74 
 
 
448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  53.65 
 
 
448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  53.4 
 
 
433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  53.63 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.41 
 
 
448 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  52.46 
 
 
441 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  53.63 
 
 
448 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  53.63 
 
 
448 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  53.63 
 
 
448 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  53.88 
 
 
448 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  56.26 
 
 
437 aa  451  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  52.78 
 
 
432 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  53.16 
 
 
434 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  53.16 
 
 
433 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  52 
 
 
457 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  50.71 
 
 
448 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  51.53 
 
 
457 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  52.68 
 
 
439 aa  428  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  51.41 
 
 
435 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  50.69 
 
 
453 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  50.35 
 
 
436 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  50.35 
 
 
436 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  51.54 
 
 
454 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  52.24 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  50.47 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  47.7 
 
 
458 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  49.76 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  49.4 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  48.26 
 
 
439 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  49.04 
 
 
454 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  49.28 
 
 
447 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  47.71 
 
 
457 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  48.56 
 
 
447 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
438 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
438 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 
511 aa  372  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  44.76 
 
 
439 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  45.07 
 
 
436 aa  362  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  44.94 
 
 
436 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  44.55 
 
 
434 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  36.87 
 
 
434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  50.81 
 
 
249 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  71.17 
 
 
175 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  44.76 
 
 
244 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.16 
 
 
244 aa  229  7e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  44.49 
 
 
244 aa  228  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  43.95 
 
 
244 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.35 
 
 
263 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.8 
 
 
245 aa  223  6e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.26 
 
 
252 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
290 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
281 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.48 
 
 
271 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  42.37 
 
 
262 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.38 
 
 
263 aa  219  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  45 
 
 
272 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.23 
 
 
253 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 
271 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 
271 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.03 
 
 
253 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  45.6 
 
 
264 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.19 
 
 
297 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  45.42 
 
 
259 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.46 
 
 
256 aa  216  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  44.49 
 
 
257 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  45.75 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  44.73 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>