More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0347 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 511 aa  1033    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  42.06 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  42.06 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  42 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  43.04 
 
 		 445 aa  359  6e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  40.57 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  42.95 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  40.87 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  42.32 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  39.87 
 
 		 447 aa  343  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  42.09 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 437 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.44 
 
 		 448 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 449 aa  334  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  40.62 
 
 		 439 aa  332  8e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  38.99 
 
 		 448 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  41.79 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  41.24 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  40.13 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  41.4 
 
 		 448 aa  323  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  39.54 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 454 aa  316  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  40.68 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.29 
 
 		 446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  41.98 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  58.27 
 
 		 432 aa  312  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  39.06 
 
 		 434 aa  310  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  57.54 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  57.09 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  57.09 
 
 		 448 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  57.09 
 
 		 448 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  57.09 
 
 		 448 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  57.41 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  58.3 
 
 		 448 aa  301  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  38.97 
 
 		 447 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  59.92 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  56.72 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  56.72 
 
 		 448 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  58.85 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  58.27 
 
 		 444 aa  299  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  58.85 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  58.85 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  58.85 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  60.24 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  58.06 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  59.04 
 
 		 448 aa  297  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  56.15 
 
 		 448 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.44 
 
 		 448 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  58.46 
 
 		 445 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  55.34 
 
 		 436 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  55.34 
 
 		 436 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  59.68 
 
 		 437 aa  296  7e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  55.21 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  55.34 
 
 		 433 aa  291  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  57.54 
 
 		 439 aa  291  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  56.18 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  52.16 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 		 438 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  54.66 
 
 		 249 aa  286  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  51.41 
 
 		 434 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  46 
 
 		 257 aa  247  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.46 
 
 		 244 aa  237  4e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  48.02 
 
 		 244 aa  237  4e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  48.46 
 
 		 244 aa  230  5e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  49.55 
 
 		 244 aa  229  8e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  42.39 
 
 		 263 aa  224  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 256 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  43.9 
 
 		 246 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  43.21 
 
 		 251 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.8 
 
 		 245 aa  218  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 		 253 aa  216  9e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.06 
 
 		 258 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.11 
 
 		 258 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.68 
 
 		 263 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 281 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.26 
 
 		 253 aa  213  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.4 
 
 		 252 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 		 261 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  42.68 
 
 		 272 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.86 
 
 		 297 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  38.82 
 
 		 256 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 272 aa  210  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.83 
 
 		 259 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 272 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.75 
 
 		 257 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>