More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3247 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  92.86 
 
 		 449 aa  788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  76.98 
 
 		 448 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  100 
 
 		 457 aa  914    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  77.8 
 
 		 448 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  98.91 
 
 		 457 aa  902    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  58.66 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  52 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  52 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  52.44 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 438 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  51.28 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  51.02 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  52.11 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  50.69 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  51.68 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.53 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  48.34 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  49.32 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  48.74 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  48.85 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  51.6 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  48.85 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  48.85 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  48.85 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  48.6 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  49.16 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.62 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  49.88 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  48.62 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  51.24 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  51.24 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  51.24 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  51.24 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  48.51 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  50.99 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  48.82 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  50 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  48.85 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.81 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  48.95 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  46.67 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  47.88 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  46.82 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  48.99 
 
 		 433 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  48.99 
 
 		 434 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  46.99 
 
 		 457 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  44.93 
 
 		 436 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  46.51 
 
 		 454 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  44.93 
 
 		 436 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 438 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  45.89 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  45.65 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  44.89 
 
 		 436 aa  335  9e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  43.97 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  44.89 
 
 		 447 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  43.91 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  42.92 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  53.23 
 
 		 249 aa  273  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  37.88 
 
 		 434 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.56 
 
 		 244 aa  226  6e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  48.66 
 
 		 244 aa  226  7e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.75 
 
 		 253 aa  225  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.36 
 
 		 253 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.83 
 
 		 245 aa  223  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.44 
 
 		 258 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  43.9 
 
 		 269 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.83 
 
 		 263 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  46.26 
 
 		 244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.47 
 
 		 256 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  45.06 
 
 		 244 aa  219  7e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  44.05 
 
 		 259 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 254 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.76 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.5 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.76 
 
 		 263 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  44.22 
 
 		 261 aa  216  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 264 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  43.2 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  44 
 
 		 260 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  42.86 
 
 		 307 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.96 
 
 		 284 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  41.7 
 
 		 272 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.11 
 
 		 288 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 		 252 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>