More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3496 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  86.64 
 
 
437 aa  749    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  862    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  65.49 
 
 
445 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  65.26 
 
 
445 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  61.5 
 
 
435 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  60.33 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  60.05 
 
 
437 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58.74 
 
 
445 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.01 
 
 
448 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  57.66 
 
 
433 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  58.5 
 
 
445 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  58.5 
 
 
445 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  58.5 
 
 
445 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  58.5 
 
 
445 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  58.25 
 
 
445 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  56.81 
 
 
448 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  56.81 
 
 
448 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  56.81 
 
 
448 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  57.51 
 
 
448 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  58.25 
 
 
445 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  58.25 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  58.25 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  58.25 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  58.25 
 
 
450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  58.01 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  58.25 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  58.25 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  57.04 
 
 
453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  58.25 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  58.25 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  56.26 
 
 
432 aa  464  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  56.26 
 
 
432 aa  464  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  57 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.56 
 
 
446 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  57 
 
 
448 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.04 
 
 
448 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  55.98 
 
 
447 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  54.91 
 
 
444 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  52.79 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  56.71 
 
 
433 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  56.56 
 
 
441 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  57.38 
 
 
433 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  56.53 
 
 
435 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  53.32 
 
 
453 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  55.95 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  53.46 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  58.23 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  55.48 
 
 
439 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  57.72 
 
 
434 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  53.25 
 
 
448 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  52.91 
 
 
458 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  55.48 
 
 
454 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  52.1 
 
 
457 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  52.11 
 
 
457 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  54.13 
 
 
436 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  52.12 
 
 
448 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  54.13 
 
 
436 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  52.35 
 
 
439 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  51.88 
 
 
449 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  51.07 
 
 
454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  52.49 
 
 
440 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  52.12 
 
 
426 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  50.72 
 
 
457 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  50.72 
 
 
438 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  50.72 
 
 
438 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  51.93 
 
 
447 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  50.12 
 
 
439 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  52.15 
 
 
447 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  49.43 
 
 
436 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  50.47 
 
 
436 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  49.26 
 
 
434 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  59.68 
 
 
511 aa  309  5e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  57.49 
 
 
249 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 
256 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
262 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.6 
 
 
258 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  52.31 
 
 
297 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.9 
 
 
252 aa  229  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  49.56 
 
 
244 aa  226  7e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  44.58 
 
 
258 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.8 
 
 
263 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 
211 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  49.33 
 
 
244 aa  220  3e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.52 
 
 
274 aa  221  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  48.88 
 
 
261 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.35 
 
 
274 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  48 
 
 
244 aa  219  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  45.33 
 
 
244 aa  218  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 
253 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  43.6 
 
 
251 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  65.84 
 
 
175 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.96 
 
 
263 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  45.32 
 
 
286 aa  216  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.61 
 
 
260 aa  216  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  43.87 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.58 
 
 
272 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  43.49 
 
 
278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>