More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6182 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  89.71 
 
 		 447 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  100 
 
 		 447 aa  888    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  69.72 
 
 		 436 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  69.72 
 
 		 436 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  67.13 
 
 		 457 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  67.13 
 
 		 438 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  66.9 
 
 		 438 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  67.22 
 
 		 454 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  57.38 
 
 		 448 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  55.94 
 
 		 450 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  56.14 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  56.14 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  55.48 
 
 		 445 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  57.48 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  56.14 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  55.48 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  56.14 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  56.14 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  55.48 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  55.48 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  55.48 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  55.81 
 
 		 445 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  56.14 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  56.14 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  57.14 
 
 		 448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  55.97 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  56.44 
 
 		 448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  55.25 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  54.24 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  54.18 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  54.8 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  54.8 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  54.8 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  53.24 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  54.76 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  54.27 
 
 		 444 aa  450  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.88 
 
 		 446 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  53.88 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  52.83 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  52.52 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  51.92 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  53.92 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  52.13 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  50.94 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  52.09 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  55.11 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  51.2 
 
 		 437 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  48.56 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  48.56 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 434 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  50.58 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  49.89 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  52.15 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  51.4 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  46.28 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  45.43 
 
 		 458 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  44.1 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  44.89 
 
 		 457 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  44.76 
 
 		 457 aa  349  6e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  45.22 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 454 aa  342  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  45.64 
 
 		 440 aa  338  9e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  42.46 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 		 511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  42.79 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  42.52 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  42.32 
 
 		 439 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  42.33 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 		 434 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  53.44 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  43.1 
 
 		 257 aa  219  7.999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  47.39 
 
 		 245 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  64.46 
 
 		 175 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  44.94 
 
 		 244 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.34 
 
 		 244 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  46.43 
 
 		 244 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  43.32 
 
 		 244 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  62.78 
 
 		 211 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  40.87 
 
 		 251 aa  203  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 281 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  41.81 
 
 		 263 aa  202  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  40.15 
 
 		 286 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  41.53 
 
 		 258 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.1 
 
 		 253 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.42 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 254 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 264 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  45.78 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.21 
 
 		 252 aa  199  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.12 
 
 		 288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  42.91 
 
 		 260 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  43.23 
 
 		 274 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  42.11 
 
 		 259 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>