More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1456 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 175 aa  346  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  86.47 
 
 		 433 aa  294  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  79.65 
 
 		 446 aa  267  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  72.84 
 
 		 447 aa  239  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  71.17 
 
 		 432 aa  236  9e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  71.17 
 
 		 432 aa  236  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  70.18 
 
 		 448 aa  235  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  73.12 
 
 		 448 aa  231  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  72.5 
 
 		 448 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  73.75 
 
 		 446 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  73.75 
 
 		 446 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  73.75 
 
 		 446 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  73.75 
 
 		 446 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  73.75 
 
 		 446 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  73.75 
 
 		 446 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  73.75 
 
 		 446 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  73.75 
 
 		 446 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  72.5 
 
 		 448 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  72.5 
 
 		 448 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  72.5 
 
 		 448 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  73.12 
 
 		 448 aa  229  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  72.5 
 
 		 448 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  72.5 
 
 		 445 aa  228  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  72.5 
 
 		 445 aa  228  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  72.5 
 
 		 450 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  72.5 
 
 		 445 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  72.5 
 
 		 445 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  72.5 
 
 		 453 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  72.5 
 
 		 445 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  72.5 
 
 		 445 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  72.5 
 
 		 448 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  68.94 
 
 		 445 aa  227  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  70.48 
 
 		 437 aa  226  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  71.88 
 
 		 445 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  71.6 
 
 		 435 aa  223  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  66.86 
 
 		 439 aa  222  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  68.07 
 
 		 433 aa  220  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  67.47 
 
 		 435 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  71.25 
 
 		 453 aa  219  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  68.12 
 
 		 445 aa  219  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  68.75 
 
 		 433 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  70.99 
 
 		 440 aa  218  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  62.35 
 
 		 438 aa  217  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  63.91 
 
 		 436 aa  216  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  63.91 
 
 		 436 aa  216  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  63.98 
 
 		 437 aa  216  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 434 aa  216  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  67.7 
 
 		 444 aa  214  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  65.03 
 
 		 441 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  66.25 
 
 		 454 aa  208  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  70.62 
 
 		 435 aa  207  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  68.94 
 
 		 433 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  63.23 
 
 		 432 aa  206  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  63.69 
 
 		 454 aa  205  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  64.46 
 
 		 447 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  61.9 
 
 		 448 aa  204  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  65.62 
 
 		 447 aa  204  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  62.05 
 
 		 457 aa  204  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  67.08 
 
 		 434 aa  203  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  65.84 
 
 		 437 aa  203  8e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  59.28 
 
 		 511 aa  202  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  62.05 
 
 		 457 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  64.2 
 
 		 457 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  64.2 
 
 		 438 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  64.2 
 
 		 438 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  58.39 
 
 		 458 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  57.76 
 
 		 426 aa  192  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  67.7 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 449 aa  188  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  63.12 
 
 		 448 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  62.5 
 
 		 439 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  53.29 
 
 		 439 aa  173  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  53.7 
 
 		 436 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  53.7 
 
 		 436 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  55 
 
 		 249 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  51.81 
 
 		 434 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.57 
 
 		 253 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  52.2 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  50.62 
 
 		 434 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.68 
 
 		 258 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 		 256 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  51.25 
 
 		 273 aa  157  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.25 
 
 		 264 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 		 264 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  56.25 
 
 		 274 aa  154  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  55.4 
 
 		 255 aa  154  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.17 
 
 		 257 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.65 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  48.12 
 
 		 249 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.69 
 
 		 251 aa  152  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.54 
 
 		 246 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50.62 
 
 		 257 aa  151  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.43 
 
 		 259 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50.34 
 
 		 288 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  47.83 
 
 		 259 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 		 281 aa  150  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  53.46 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.75 
 
 		 244 aa  149  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  48.12 
 
 		 244 aa  149  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  42.77 
 
 		 265 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>