More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4537 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  100 
 
 		 436 aa  879    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  100 
 
 		 436 aa  879    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  68.07 
 
 		 457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  67.76 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  68.07 
 
 		 438 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  68.07 
 
 		 438 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  69.72 
 
 		 447 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  69.52 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  59.48 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  59.25 
 
 		 448 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.25 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.53 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  60.71 
 
 		 446 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  59.29 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  58.88 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  59.29 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  59.29 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  59.29 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  59.15 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  59.06 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  58.41 
 
 		 453 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  58.89 
 
 		 450 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58.18 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  58.18 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  58.18 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  57.28 
 
 		 447 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  58.18 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.51 
 
 		 446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  55.27 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  52.9 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  52.9 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  54.55 
 
 		 444 aa  450  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  54.25 
 
 		 448 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  53.95 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  53.27 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  52.45 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  54.07 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  52.47 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  53.76 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  50.35 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  50.35 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  51.16 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  54.13 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  52.35 
 
 		 434 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  52.71 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  50.23 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  52.34 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  48.03 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  47.22 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  48.32 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  46.74 
 
 		 448 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  45.27 
 
 		 458 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  45.56 
 
 		 457 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  47.34 
 
 		 454 aa  349  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  44.91 
 
 		 457 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 		 439 aa  345  8e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 449 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  45.37 
 
 		 448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  43.91 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  42.45 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  42.55 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  55.34 
 
 		 511 aa  296  5e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  40.19 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  41.61 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  52.23 
 
 		 249 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.99 
 
 		 244 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 		 262 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  46.15 
 
 		 244 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  46.15 
 
 		 244 aa  223  6e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  45.34 
 
 		 244 aa  221  3e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  41.8 
 
 		 257 aa  218  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  63.91 
 
 		 175 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.37 
 
 		 252 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  60.64 
 
 		 211 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 256 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  47.2 
 
 		 245 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.83 
 
 		 263 aa  209  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.04 
 
 		 258 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  42.8 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  42.8 
 
 		 270 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  44.64 
 
 		 275 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 281 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.32 
 
 		 260 aa  202  9e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  41.41 
 
 		 257 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.54 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.06 
 
 		 259 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  42.29 
 
 		 269 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.57 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>