More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4341 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  100 
 
 		 448 aa  892    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  68.93 
 
 		 447 aa  616  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  70.09 
 
 		 433 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  70.09 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  68.56 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  70.25 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  66.21 
 
 		 446 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  68.59 
 
 		 434 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  68.59 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  64.85 
 
 		 444 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  65.37 
 
 		 441 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  61.89 
 
 		 448 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  62.75 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  64.79 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  64.79 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  62.75 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  64.79 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.33 
 
 		 448 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  64.55 
 
 		 450 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  62.92 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  63.72 
 
 		 446 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  61.85 
 
 		 448 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  64.55 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  64.79 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  61.89 
 
 		 453 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  62.75 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  64.79 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  62.75 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  62.75 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  62.75 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  62.75 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  61.45 
 
 		 448 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.63 
 
 		 448 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  61.45 
 
 		 448 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  61.45 
 
 		 448 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  62.53 
 
 		 448 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  63.95 
 
 		 439 aa  521  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  60.63 
 
 		 453 aa  521  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  59.4 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  60.32 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  57.83 
 
 		 445 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  57.83 
 
 		 445 aa  477  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  54.52 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  54.52 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  53.7 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  53.7 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  54.25 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  54.25 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  53.69 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  55.95 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  49.64 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  51.64 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  51.64 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  51.64 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  47.29 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  49.77 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  52.83 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  53.33 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  49.16 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  48.15 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 		 448 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  48.37 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  48.84 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  49.64 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  46.62 
 
 		 454 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  45.56 
 
 		 439 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  63.16 
 
 		 262 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  43.84 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  44.19 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  43.25 
 
 		 436 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  38.99 
 
 		 511 aa  331  1e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  55.92 
 
 		 249 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  37.3 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.99 
 
 		 244 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  72.34 
 
 		 211 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  70.18 
 
 		 175 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  48.36 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  47.76 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  46.94 
 
 		 244 aa  230  3e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  50.88 
 
 		 255 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.59 
 
 		 263 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 254 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.14 
 
 		 281 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  45.25 
 
 		 286 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  45.7 
 
 		 267 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.08 
 
 		 297 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.47 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 260 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50.46 
 
 		 288 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  50.21 
 
 		 264 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.2 
 
 		 259 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  43.91 
 
 		 257 aa  221  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 		 271 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  44.4 
 
 		 273 aa  219  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  49.38 
 
 		 256 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.42 
 
 		 258 aa  219  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.37 
 
 		 272 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>