More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2719 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  100 
 
 		 454 aa  904    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  61.98 
 
 		 440 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  51.05 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  54.78 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  51.54 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  51.54 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  55.48 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  53.15 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  51.5 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  48.16 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  52.37 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  48.6 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  48.96 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  49.88 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  48.83 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.6 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  47.19 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  47.19 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  48.71 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  48.17 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  47.19 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  47.66 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  47.19 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  46.88 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.78 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  46.51 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  48.01 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  46.97 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  46.43 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  46.43 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  46.43 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  46.43 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  47.1 
 
 		 448 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.82 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  46.36 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.51 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  46.7 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  47.74 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  46.59 
 
 		 448 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  47.41 
 
 		 444 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  48.37 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  46.01 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  46.62 
 
 		 448 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  45.39 
 
 		 457 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  47.85 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 454 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  46.81 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  45.16 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  46.24 
 
 		 433 aa  356  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  47.05 
 
 		 448 aa  355  8.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  46.63 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  47.34 
 
 		 436 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  47.34 
 
 		 436 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  48.13 
 
 		 439 aa  349  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  46.46 
 
 		 449 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 		 438 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  47.54 
 
 		 457 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  47.88 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  45.8 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  46.03 
 
 		 447 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  52.82 
 
 		 249 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.79 
 
 		 244 aa  231  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.7 
 
 		 263 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.26 
 
 		 258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.92 
 
 		 256 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  49.11 
 
 		 244 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.67 
 
 		 251 aa  217  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  45.16 
 
 		 244 aa  216  5e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  46.77 
 
 		 244 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 261 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.37 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.22 
 
 		 245 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 264 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  42.75 
 
 		 303 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  42.01 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  42.01 
 
 		 303 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.26 
 
 		 263 aa  209  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 261 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  41.2 
 
 		 257 aa  209  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 		 175 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.63 
 
 		 297 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  57.67 
 
 		 211 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.26 
 
 		 252 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  49.79 
 
 		 263 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.08 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>