More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0430 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  74.17 
 
 		 435 aa  634    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  73.61 
 
 		 435 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  100 
 
 		 437 aa  872    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  63.17 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  58.91 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  58.91 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  58.91 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  59.4 
 
 		 448 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  58.91 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  58.91 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  58.91 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  58.91 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  58.49 
 
 		 446 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  57.96 
 
 		 448 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  58.43 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58.43 
 
 		 448 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  59.25 
 
 		 433 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  57.31 
 
 		 445 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.08 
 
 		 445 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  57.31 
 
 		 445 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  56.84 
 
 		 448 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  57.08 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  56.84 
 
 		 448 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  57.31 
 
 		 445 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  57.08 
 
 		 448 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  57.31 
 
 		 445 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  56.84 
 
 		 453 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  57.31 
 
 		 445 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  56.84 
 
 		 448 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  57.24 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  58.97 
 
 		 441 aa  500  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  56.18 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  56.18 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  56.84 
 
 		 448 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  58.73 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  60.56 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.37 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  58.97 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  59.02 
 
 		 433 aa  487  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  55.17 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  58.6 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  55.17 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  60.05 
 
 		 437 aa  477  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  56.88 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  56.19 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  58.6 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  56.38 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  55.22 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  57.75 
 
 		 439 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  52.48 
 
 		 457 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  51.98 
 
 		 457 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  52.08 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  52.45 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  52.45 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  52.46 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  53.43 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  51.17 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  51.16 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  48.06 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  50.72 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  51.2 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  51.2 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  49.88 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  49.41 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  48.28 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  45.35 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  45.25 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  46.01 
 
 		 434 aa  348  8e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 511 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  39.19 
 
 		 434 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  50.96 
 
 		 262 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  52.24 
 
 		 249 aa  262  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.58 
 
 		 244 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  45.9 
 
 		 244 aa  231  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  45.34 
 
 		 244 aa  230  5e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  70.48 
 
 		 175 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  65.96 
 
 		 211 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  43.72 
 
 		 244 aa  225  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.23 
 
 		 263 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  48.16 
 
 		 245 aa  223  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.19 
 
 		 263 aa  220  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.94 
 
 		 258 aa  219  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  41.9 
 
 		 252 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  42.21 
 
 		 257 aa  217  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.05 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.96 
 
 		 253 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.8 
 
 		 253 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 281 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  44.66 
 
 		 259 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  44.84 
 
 		 272 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 256 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  45.24 
 
 		 260 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.77 
 
 		 271 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  41.25 
 
 		 279 aa  212  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>