More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1439 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  100 
 
 
439 aa  887    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  69.84 
 
 
453 aa  586  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  66.82 
 
 
447 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.25 
 
 
446 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  62.07 
 
 
433 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  63.95 
 
 
448 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  62.62 
 
 
446 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  60.97 
 
 
444 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  62.62 
 
 
446 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  62.85 
 
 
446 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  62.62 
 
 
446 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  62.62 
 
 
446 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  62.62 
 
 
446 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  62.62 
 
 
446 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  62.62 
 
 
446 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  63.03 
 
 
445 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  62.62 
 
 
448 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  62.8 
 
 
448 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  63.03 
 
 
445 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  63.03 
 
 
445 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  62.8 
 
 
453 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  63.03 
 
 
445 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  63.03 
 
 
445 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  61.59 
 
 
441 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.92 
 
 
448 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  62.12 
 
 
433 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  62.12 
 
 
433 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  61.92 
 
 
448 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  62.15 
 
 
450 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  62.8 
 
 
445 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  61.92 
 
 
448 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  61.68 
 
 
448 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  61.92 
 
 
448 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  62.38 
 
 
445 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.45 
 
 
448 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  60.33 
 
 
434 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  60.56 
 
 
433 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  61.74 
 
 
435 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  57.75 
 
 
437 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  56.39 
 
 
435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 
434 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 
438 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
435 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  54.85 
 
 
437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  52.68 
 
 
432 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  52.68 
 
 
432 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  54.39 
 
 
445 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  52.33 
 
 
454 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  55.48 
 
 
437 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  51.4 
 
 
448 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  51.16 
 
 
436 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  51.16 
 
 
436 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  53.46 
 
 
445 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  52.84 
 
 
457 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  52.84 
 
 
438 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  52.84 
 
 
438 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  51.68 
 
 
457 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  51.44 
 
 
457 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  51.3 
 
 
447 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  51.49 
 
 
448 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  50.36 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  51.06 
 
 
447 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  52.03 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  48.85 
 
 
440 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  48.72 
 
 
426 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  48.37 
 
 
454 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 
439 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  45.89 
 
 
458 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 
511 aa  354  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  43.02 
 
 
436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  43.65 
 
 
439 aa  332  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  42.33 
 
 
436 aa  330  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  60.15 
 
 
262 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  42.82 
 
 
434 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  55.47 
 
 
249 aa  283  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  38.11 
 
 
434 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  47.77 
 
 
244 aa  237  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  44.94 
 
 
244 aa  234  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.75 
 
 
244 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  66.86 
 
 
175 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  46.31 
 
 
244 aa  233  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  48.39 
 
 
245 aa  229  7e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  67.02 
 
 
211 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  50.68 
 
 
274 aa  219  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.38 
 
 
252 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.38 
 
 
253 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.26 
 
 
263 aa  216  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.22 
 
 
257 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  43.41 
 
 
258 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  46.98 
 
 
275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.68 
 
 
253 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.25 
 
 
263 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  43.08 
 
 
272 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
290 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  42.86 
 
 
284 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.13 
 
 
297 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
278 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
254 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  42.68 
 
 
258 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  42.75 
 
 
273 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>