More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2401 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  93.53 
 
 
448 aa  841    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  95.96 
 
 
446 aa  860    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  94.64 
 
 
448 aa  856    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  95.96 
 
 
446 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  99.55 
 
 
445 aa  898    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  93.97 
 
 
448 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  95.07 
 
 
446 aa  840    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  100 
 
 
445 aa  900    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  91.29 
 
 
448 aa  826    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  99.78 
 
 
445 aa  898    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  94.64 
 
 
448 aa  856    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  95.96 
 
 
446 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  100 
 
 
445 aa  900    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  95.96 
 
 
446 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  100 
 
 
445 aa  900    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  96.88 
 
 
453 aa  879    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  100 
 
 
445 aa  900    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  98.43 
 
 
445 aa  887    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  94.64 
 
 
448 aa  856    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  90.85 
 
 
448 aa  825    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  95.96 
 
 
446 aa  860    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  97.32 
 
 
448 aa  881    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  95.96 
 
 
446 aa  860    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  95.78 
 
 
450 aa  869    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  95.96 
 
 
446 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  64.41 
 
 
447 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  63.74 
 
 
433 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  63.7 
 
 
444 aa  541  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  62.91 
 
 
441 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  64.79 
 
 
448 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.76 
 
 
446 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  61.56 
 
 
433 aa  521  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  61.79 
 
 
433 aa  522  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  60.47 
 
 
435 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  63.44 
 
 
435 aa  512  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  63.03 
 
 
439 aa  514  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  61.14 
 
 
435 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  61.65 
 
 
433 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  61.18 
 
 
434 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  57.31 
 
 
437 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  59.29 
 
 
436 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  59.29 
 
 
436 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  55.65 
 
 
453 aa  481  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  56.8 
 
 
437 aa  474  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  57.38 
 
 
445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  55.63 
 
 
434 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  55.63 
 
 
438 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  58.5 
 
 
437 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  54.57 
 
 
432 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  54.57 
 
 
432 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  53.55 
 
 
454 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  56.19 
 
 
445 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  56.43 
 
 
447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  55.77 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  55.77 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  55.48 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  55.31 
 
 
438 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  50.84 
 
 
432 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  51.06 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  50.8 
 
 
448 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  48.85 
 
 
457 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  48.85 
 
 
457 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  47.92 
 
 
458 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
449 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  50.25 
 
 
426 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  47.19 
 
 
454 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
440 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  48.26 
 
 
439 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  46.79 
 
 
439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  45.48 
 
 
436 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  45.86 
 
 
434 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  44.68 
 
 
436 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 
262 aa  305  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 
511 aa  299  6e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  56.15 
 
 
249 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  39.19 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.29 
 
 
244 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  77.64 
 
 
211 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  49.14 
 
 
244 aa  238  2e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  47.23 
 
 
244 aa  231  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  47.01 
 
 
244 aa  229  5e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  72.5 
 
 
175 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.8 
 
 
245 aa  226  7e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.48 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.43 
 
 
258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.09 
 
 
263 aa  220  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.31 
 
 
263 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.27 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  41.49 
 
 
257 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 
256 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  46.36 
 
 
264 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.27 
 
 
260 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.09 
 
 
274 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
281 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.58 
 
 
269 aa  213  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  46.72 
 
 
257 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.86 
 
 
297 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.14 
 
 
288 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
264 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.1 
 
 
259 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>