More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0896 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  520  1e-147  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1377  ABC transporter related  62.19 
 
 
215 aa  271  9e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.874611  hitchhiker  0.000287507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0272  ABC transporter related protein  58.14 
 
 
232 aa  263  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 
511 aa  247  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  46.22 
 
 
432 aa  240  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  47.23 
 
 
249 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  47.66 
 
 
244 aa  236  3e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  45.96 
 
 
244 aa  235  6e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  52.17 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.89 
 
 
244 aa  230  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  42.62 
 
 
447 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  45.11 
 
 
426 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 
434 aa  225  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  44.16 
 
 
438 aa  225  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.83 
 
 
446 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  42.39 
 
 
453 aa  221  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  43.91 
 
 
448 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  45.89 
 
 
447 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  43.21 
 
 
440 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  42.98 
 
 
448 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  43.37 
 
 
444 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.98 
 
 
448 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  42.98 
 
 
448 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  42.86 
 
 
441 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  41.8 
 
 
436 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  41.8 
 
 
436 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  44.16 
 
 
244 aa  217  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
437 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.49 
 
 
448 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 
438 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  41.49 
 
 
448 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  41.49 
 
 
448 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  41.49 
 
 
448 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  44.49 
 
 
432 aa  215  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  44.49 
 
 
432 aa  215  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
438 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  42.45 
 
 
457 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 
433 aa  214  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  41.49 
 
 
445 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  41.49 
 
 
448 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.49 
 
 
445 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  43.1 
 
 
447 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  41.49 
 
 
445 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  41.49 
 
 
445 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  41.49 
 
 
453 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  41.49 
 
 
445 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  41.49 
 
 
445 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.24 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  41.49 
 
 
450 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
446 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  41.74 
 
 
446 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
446 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
446 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
446 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
446 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
446 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
446 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45 
 
 
263 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  41.08 
 
 
445 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 
435 aa  211  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.15 
 
 
258 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 
434 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 
435 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
454 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  41.67 
 
 
445 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  42.22 
 
 
457 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  42.08 
 
 
435 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  40.83 
 
 
439 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
454 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  42.44 
 
 
445 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.27 
 
 
253 aa  205  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  41.42 
 
 
437 aa  204  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  43.97 
 
 
274 aa  204  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  41.78 
 
 
448 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  41.96 
 
 
436 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 
253 aa  202  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  40.89 
 
 
436 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  41.33 
 
 
457 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  45.87 
 
 
256 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  43.37 
 
 
265 aa  202  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
439 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 
434 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  40.08 
 
 
434 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  42.42 
 
 
439 aa  201  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  41 
 
 
458 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  43.75 
 
 
433 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.22 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  41.59 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.56 
 
 
260 aa  199  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 
254 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42 
 
 
267 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  40.87 
 
 
433 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  40.87 
 
 
433 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.54 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.22 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.49 
 
 
254 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 
252 aa  198  6e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.8 
 
 
254 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
261 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.49 
 
 
254 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>