More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1377 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1377  ABC transporter related  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.874611  hitchhiker  0.000287507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0272  ABC transporter related protein  78.57 
 
 		 232 aa  335  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  62.19 
 
 		 257 aa  271  7e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  46.6 
 
 		 441 aa  203  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 511 aa  202  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  46.83 
 
 		 438 aa  201  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 434 aa  201  5e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  48.29 
 
 		 445 aa  201  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  48.29 
 
 		 445 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  45.15 
 
 		 444 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  45.37 
 
 		 453 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  50.24 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.37 
 
 		 446 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  45.37 
 
 		 448 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  47.8 
 
 		 437 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  45.85 
 
 		 435 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  47.8 
 
 		 440 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  46.83 
 
 		 437 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  48.51 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  44.88 
 
 		 436 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 426 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  44.88 
 
 		 436 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  48.26 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  44.39 
 
 		 448 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  44.88 
 
 		 433 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  44.39 
 
 		 448 aa  191  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.6 
 
 		 245 aa  191  9e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.39 
 
 		 448 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  42.86 
 
 		 447 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  45.1 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  43.9 
 
 		 453 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  43.9 
 
 		 448 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  43.9 
 
 		 445 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  43.9 
 
 		 445 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  43.9 
 
 		 450 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  43.9 
 
 		 445 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  43.9 
 
 		 445 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  43.9 
 
 		 445 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  44.88 
 
 		 434 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  42.65 
 
 		 432 aa  187  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 446 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 446 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 446 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.41 
 
 		 445 aa  187  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 446 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 446 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 446 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 446 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  44.88 
 
 		 435 aa  187  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  43.9 
 
 		 432 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  43.9 
 
 		 432 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  44.88 
 
 		 435 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 446 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  43.41 
 
 		 445 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  44.39 
 
 		 447 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  44.5 
 
 		 433 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  46.57 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  43.41 
 
 		 448 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  43.41 
 
 		 448 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  43.41 
 
 		 448 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 454 aa  185  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.93 
 
 		 448 aa  184  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 454 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  43.41 
 
 		 457 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  43.41 
 
 		 457 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 438 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 438 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  42.93 
 
 		 436 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  42.93 
 
 		 457 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  47.32 
 
 		 437 aa  180  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  41.95 
 
 		 436 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  43.2 
 
 		 439 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  43.9 
 
 		 447 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  43.41 
 
 		 448 aa  177  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 449 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.34 
 
 		 297 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  44.39 
 
 		 439 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  43.41 
 
 		 439 aa  175  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  41.46 
 
 		 448 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  43.69 
 
 		 458 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  44.5 
 
 		 275 aa  174  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  41.26 
 
 		 434 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  42.93 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  41.55 
 
 		 433 aa  170  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  41.55 
 
 		 433 aa  170  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  39.81 
 
 		 275 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.44 
 
 		 258 aa  169  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.74 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  43.3 
 
 		 252 aa  168  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  43.81 
 
 		 284 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.81 
 
 		 252 aa  167  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 		 434 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  42.44 
 
 		 274 aa  166  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  43.69 
 
 		 272 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.16 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  40.28 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  41.95 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  43.09 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  41.26 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>