More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0271 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  100 
 
 		 435 aa  862    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  71.86 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  71.63 
 
 		 434 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  70.25 
 
 		 448 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  65.45 
 
 		 441 aa  569  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  67.21 
 
 		 446 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  68.15 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  67.83 
 
 		 433 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  66.28 
 
 		 447 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  63.4 
 
 		 444 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  64.57 
 
 		 433 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  64.15 
 
 		 448 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  63.68 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  63.68 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  63.68 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  63.68 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  63.68 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  63.92 
 
 		 448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  63.68 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  63.44 
 
 		 453 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  63.68 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  63.68 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  63.44 
 
 		 445 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  63.44 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  63.44 
 
 		 445 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  63.44 
 
 		 445 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  63.44 
 
 		 445 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  63.21 
 
 		 448 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  63.44 
 
 		 445 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.97 
 
 		 448 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  62.97 
 
 		 448 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  63.44 
 
 		 445 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  63.21 
 
 		 445 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  62.97 
 
 		 448 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  63.21 
 
 		 450 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  62.97 
 
 		 448 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  61.74 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  59.77 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  58.45 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  56.38 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  58.69 
 
 		 435 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  55.97 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  51.99 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  51.99 
 
 		 434 aa  435  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  56.53 
 
 		 437 aa  435  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  54.23 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  56.05 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  51.41 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  51.41 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  53.76 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  53.76 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  55.29 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  47.18 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  53.18 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  53.18 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  53.18 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  54.86 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  52.48 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  55.11 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  48.83 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  48.28 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  47.32 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  47.88 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  47.88 
 
 		 457 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  45.75 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  51.13 
 
 		 439 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  45.58 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  45.58 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 440 aa  352  8e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 426 aa  352  8e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  43.72 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  60.92 
 
 		 262 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 511 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  77.72 
 
 		 211 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  52.85 
 
 		 249 aa  259  8e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  39.53 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.37 
 
 		 244 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  47.37 
 
 		 245 aa  229  7e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  47.33 
 
 		 244 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  45.53 
 
 		 244 aa  223  6e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.12 
 
 		 244 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.72 
 
 		 274 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.62 
 
 		 263 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  47.41 
 
 		 255 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  45.53 
 
 		 261 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  70.62 
 
 		 175 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  42.08 
 
 		 257 aa  206  5e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.22 
 
 		 267 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  41.83 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  44.4 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.9 
 
 		 264 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 		 271 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 252 aa  203  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.32 
 
 		 254 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  44.76 
 
 		 272 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 256 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.39 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.3 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.49 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>