More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0522 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  54.8 
 
 
252 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  51.24 
 
 
251 aa  262  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.56 
 
 
258 aa  262  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.79 
 
 
254 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.17 
 
 
253 aa  251  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.57 
 
 
263 aa  248  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  48.56 
 
 
254 aa  248  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  48.15 
 
 
254 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  51.52 
 
 
259 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  50.21 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  51.87 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.76 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.48 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.35 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.68 
 
 
254 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.06 
 
 
252 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  51.65 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  50.61 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.35 
 
 
260 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  52.61 
 
 
303 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  52.61 
 
 
303 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
254 aa  238  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  52.61 
 
 
303 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.13 
 
 
253 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 
259 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 
261 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
256 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  49.35 
 
 
261 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.59 
 
 
306 aa  235  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
281 aa  235  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.34 
 
 
259 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  48.48 
 
 
259 aa  234  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.99 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  49.37 
 
 
260 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.72 
 
 
246 aa  232  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  50.21 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  46.5 
 
 
286 aa  231  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  49.34 
 
 
297 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  47.72 
 
 
298 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  50.66 
 
 
307 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  48.78 
 
 
273 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  47.54 
 
 
278 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  47.72 
 
 
288 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.64 
 
 
252 aa  229  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  49.17 
 
 
258 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.89 
 
 
274 aa  228  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.74 
 
 
264 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.89 
 
 
260 aa  228  8e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48.37 
 
 
286 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.04 
 
 
264 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  46.09 
 
 
285 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  51.32 
 
 
286 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  49.12 
 
 
261 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  49.12 
 
 
304 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  52.21 
 
 
291 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.46 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  49.14 
 
 
264 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  48.9 
 
 
303 aa  224  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.72 
 
 
261 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  47.3 
 
 
256 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.7 
 
 
261 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  47.74 
 
 
265 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  48.44 
 
 
257 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.28 
 
 
259 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  45.64 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.7 
 
 
258 aa  221  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  48.1 
 
 
295 aa  221  6e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
265 aa  221  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  45.68 
 
 
259 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  46.84 
 
 
279 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.12 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.11 
 
 
278 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.23 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  49.56 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  45.64 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.81 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.47 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  49.56 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.55 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.45 
 
 
279 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.72 
 
 
281 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  46.47 
 
 
257 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  47.3 
 
 
281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  44.44 
 
 
260 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  45.68 
 
 
267 aa  218  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49.78 
 
 
284 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  49.07 
 
 
288 aa  218  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  46.69 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.47 
 
 
272 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  46.12 
 
 
253 aa  217  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  45.45 
 
 
256 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  45.33 
 
 
266 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.33 
 
 
267 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  49.59 
 
 
281 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.74 
 
 
267 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
260 aa  216  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  49.18 
 
 
281 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  49.18 
 
 
281 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>