More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3146 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  84.64 
 
 
266 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  61.09 
 
 
267 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58 
 
 
276 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  57.42 
 
 
274 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  57.25 
 
 
269 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  55.13 
 
 
274 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 
267 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  57.31 
 
 
252 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  58.87 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  57.31 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  54.92 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  59.09 
 
 
268 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.1 
 
 
324 aa  278  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  58.94 
 
 
267 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  57.36 
 
 
259 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  56.56 
 
 
246 aa  275  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  57.61 
 
 
271 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  57.32 
 
 
270 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  54.62 
 
 
284 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  57.03 
 
 
257 aa  265  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  53.21 
 
 
282 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  53.75 
 
 
261 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  52.31 
 
 
304 aa  261  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  53.33 
 
 
277 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  52.31 
 
 
306 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  52.31 
 
 
299 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  55.04 
 
 
276 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  53.52 
 
 
284 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  53.04 
 
 
246 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.89 
 
 
258 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
268 aa  222  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  47.64 
 
 
274 aa  219  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  50.2 
 
 
258 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  46.51 
 
 
273 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  45.63 
 
 
273 aa  215  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  43.92 
 
 
299 aa  214  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  48.72 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  47.79 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.89 
 
 
278 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  44.71 
 
 
276 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  43.63 
 
 
260 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  46.09 
 
 
257 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 
311 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  45.99 
 
 
269 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  43.58 
 
 
271 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.05 
 
 
281 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  41.25 
 
 
271 aa  208  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.8 
 
 
254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.73 
 
 
254 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.79 
 
 
252 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.4 
 
 
254 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.67 
 
 
251 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  45.28 
 
 
283 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 
275 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  44.66 
 
 
278 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  42.86 
 
 
265 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 
253 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  43.68 
 
 
299 aa  205  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  41.7 
 
 
267 aa  204  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  47.86 
 
 
311 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.91 
 
 
304 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.11 
 
 
254 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  45.16 
 
 
264 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.81 
 
 
330 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
276 aa  201  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  43.63 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.57 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.93 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  47.2 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  42.39 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  43.81 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.5 
 
 
263 aa  199  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.43 
 
 
267 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  44 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.83 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  49.54 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  46.82 
 
 
246 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  43.39 
 
 
263 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  41.77 
 
 
259 aa  198  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.64 
 
 
264 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  40.96 
 
 
255 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.89 
 
 
303 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  43.24 
 
 
292 aa  198  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  40.64 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  44.67 
 
 
254 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  44.35 
 
 
265 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.73 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.44 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.12 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  51.52 
 
 
284 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  51.52 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.44 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  42.91 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  43.72 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  43.31 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>