More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1733 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  100 
 
 		 284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  98.94 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  94.12 
 
 		 289 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  71.81 
 
 		 261 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  70.66 
 
 		 263 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  70.66 
 
 		 278 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  69.53 
 
 		 263 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  70.82 
 
 		 262 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  69.65 
 
 		 258 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  69.14 
 
 		 255 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  68.73 
 
 		 261 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  69.8 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  65.19 
 
 		 272 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  69.65 
 
 		 266 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  66.79 
 
 		 265 aa  357  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  63.16 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  59.06 
 
 		 278 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  54.68 
 
 		 274 aa  278  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  55.89 
 
 		 268 aa  278  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  65.07 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  59.57 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  53.57 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  50 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  50.8 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  48.39 
 
 		 259 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  48.06 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  50 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  47.86 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.16 
 
 		 258 aa  235  7e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  48.41 
 
 		 266 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  46.54 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.24 
 
 		 288 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  49.6 
 
 		 264 aa  228  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.81 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  49.6 
 
 		 276 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.74 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  48.02 
 
 		 284 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  48.19 
 
 		 278 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  48.29 
 
 		 275 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  52.04 
 
 		 257 aa  221  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  48.37 
 
 		 278 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  50.72 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.73 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.01 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  47.28 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  50 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  51.61 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  51.8 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.84 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.57 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.24 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 278 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  51.27 
 
 		 267 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.67 
 
 		 292 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  49.57 
 
 		 246 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.67 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  49.36 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.91 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.49 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  51.68 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  50.82 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  47.1 
 
 		 264 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.27 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 275 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  54.13 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.63 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.45 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  49.81 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  46.13 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  50.4 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.09 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.01 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  49.43 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  44.36 
 
 		 273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.37 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.58 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.42 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  51.13 
 
 		 278 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  45.85 
 
 		 252 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  45.85 
 
 		 252 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  49.05 
 
 		 274 aa  211  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.67 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  49.79 
 
 		 246 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.23 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  45.98 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.56 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  44.57 
 
 		 267 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  44.84 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  42.97 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.45 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.8 
 
 		 267 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  47.58 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>