More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0028 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  543  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  80.48 
 
 		 276 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  73.41 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  66.25 
 
 		 246 aa  328  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  52.99 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  47.18 
 
 		 265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  50.85 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  49.39 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.34 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.85 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  48.18 
 
 		 272 aa  232  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  49.21 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  48.12 
 
 		 266 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  47.01 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  47.67 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  50.21 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  47.62 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  47.41 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  48.08 
 
 		 268 aa  225  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  45.91 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  46.59 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  46.12 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  49.58 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  45.71 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  48.28 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  48.73 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  42.63 
 
 		 252 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.79 
 
 		 330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  48.58 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  45.74 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  49.33 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  44.9 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.94 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4360  ABC transporter related  48.31 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  49.16 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50.21 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  45.38 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  45.63 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  46.99 
 
 		 333 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.78 
 
 		 254 aa  215  7e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  48.23 
 
 		 272 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  43.9 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.36 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  47.18 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.39 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  49.61 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  45.85 
 
 		 284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.32 
 
 		 311 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.13 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 261 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  42.51 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.14 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  43.6 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.23 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.63 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.58 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  47.41 
 
 		 269 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  44.06 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.99 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.36 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  46.5 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  47.01 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  47.14 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  45 
 
 		 259 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.69 
 
 		 254 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  44.92 
 
 		 278 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  47.08 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.56 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.98 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  46.09 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.85 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  43.3 
 
 		 284 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  45.64 
 
 		 284 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  42.31 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  48.7 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.37 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  45.8 
 
 		 257 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 258 aa  205  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.69 
 
 		 256 aa  205  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 252 aa  204  9e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.12 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.16 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.86 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  45.61 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  47.28 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  45.73 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  45.76 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  43.87 
 
 		 301 aa  201  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>