More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4360 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4360  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  493  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  62.55 
 
 		 259 aa  299  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  62.96 
 
 		 268 aa  292  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  61.79 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  46.83 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  48.31 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  46.95 
 
 		 265 aa  204  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  47.44 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  43.75 
 
 		 299 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  48.76 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  45.93 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  42.91 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  46.19 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  49.15 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  44.44 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  45.49 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  37.4 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  46.12 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  48.52 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  42.86 
 
 		 278 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 268 aa  191  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 		 267 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  47.21 
 
 		 269 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  51.46 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.53 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  44.16 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  50.94 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  43.36 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.21 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  42.68 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.67 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  47.84 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  43.14 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  43.46 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  44.8 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  42.92 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  45.23 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  41.63 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  43.44 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  42.44 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  43.15 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  47.37 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.95 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  41.13 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  44.35 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  48.74 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  42.92 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3410  ABC transporter related  48.19 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0325873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  46.7 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  45.1 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  44.1 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  47.19 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.19 
 
 		 276 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.44 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.23 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.52 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.75 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  42.92 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3113  ABC transporter related  44.44 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  47.19 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  43.28 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  41.63 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.37 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  50.93 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  46.98 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  42.06 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  41.7 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  45.45 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  49.01 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  43.88 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  41.63 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.99 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  39.32 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  46.72 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  50 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  42.92 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  42.86 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  43.36 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  46.98 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  41.56 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49.24 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  42.42 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  50 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  45.58 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  40.48 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  42.4 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  48.53 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>