More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3113 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3113  ABC transporter related  100 
 
 		 283 aa  564  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  58.11 
 
 		 275 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  55.76 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  53.03 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  53.88 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  47.78 
 
 		 289 aa  212  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.33 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.39 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  43.56 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.49 
 
 		 253 aa  208  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  49.03 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  43.77 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  46.62 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  48.48 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  42.25 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  43.89 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  48.26 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  42.8 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  43.23 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  43.77 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  43.63 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  44.03 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  44.84 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  45.35 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  42.15 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  43.66 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  43.8 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  47.13 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  45.17 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  45.17 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.31 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 276 aa  195  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.34 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  42.15 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  42.69 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  44.7 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.28 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.49 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.97 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  42.74 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.97 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  49.4 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  41.76 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.41 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.27 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.51 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  45.99 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.3 
 
 		 337 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  39.68 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.12 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  43.03 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  43.35 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  38.61 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  42.37 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  44.17 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  44.63 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  42.41 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  43.85 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  39.1 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  39.08 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  43.41 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  42.21 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  40.17 
 
 		 256 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.78 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  41.73 
 
 		 271 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  44.27 
 
 		 275 aa  185  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  43.03 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.67 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  42.02 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  41.47 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.67 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  41.15 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  48.76 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  44.21 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2375  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.8 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  40.16 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  43.01 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  44.32 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.04 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.47 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  40.65 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  44.9 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  39.11 
 
 		 288 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.32 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.25 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>