More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3453 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  64.31 
 
 		 261 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  64.03 
 
 		 289 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  65.73 
 
 		 284 aa  332  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  65.73 
 
 		 284 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  61.54 
 
 		 263 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  62.75 
 
 		 261 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  62.85 
 
 		 263 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  61.57 
 
 		 258 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  60.31 
 
 		 272 aa  319  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  61.66 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  61.13 
 
 		 278 aa  315  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  58.87 
 
 		 278 aa  315  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  60.62 
 
 		 265 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  57.98 
 
 		 262 aa  309  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  59.62 
 
 		 266 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  59.68 
 
 		 333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  61.11 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  61.7 
 
 		 274 aa  278  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  59.33 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.97 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.09 
 
 		 330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  48.4 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  49.61 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  51.57 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  51.05 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  48.03 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.6 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  51.5 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.81 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  47.69 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.99 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.85 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  47.83 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  46.18 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  53.99 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  49.78 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  46.56 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  54.46 
 
 		 246 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.81 
 
 		 291 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  47.44 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  45.1 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  46.25 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  45.56 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  45.83 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  51.35 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  50.83 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.21 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  44.96 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.93 
 
 		 253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  46.79 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.78 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  49.79 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  50 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.72 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  48.75 
 
 		 268 aa  212  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 299 aa  211  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  50.22 
 
 		 276 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  46.75 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.54 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.96 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  51.18 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  44.11 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 260 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.11 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.77 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.67 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  49.36 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  48.57 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  44.79 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  49.1 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  47.88 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  51.24 
 
 		 301 aa  208  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 		 261 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  51.11 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  49.15 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  47.11 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  49.35 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  48.73 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  54.23 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  47.7 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.75 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  46.3 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  55.56 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.56 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.83 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  46.72 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  47.68 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.65 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  46.72 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.06 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3113  ABC transporter related  48.61 
 
 		 283 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0374079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>