More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1496 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  83.33 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  80 
 
 		 272 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  80 
 
 		 265 aa  427  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  79.61 
 
 		 266 aa  427  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  77.65 
 
 		 263 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  77.25 
 
 		 263 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  77.25 
 
 		 261 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  77.08 
 
 		 258 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  73.05 
 
 		 262 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  70.2 
 
 		 278 aa  384  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  67.97 
 
 		 289 aa  370  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  69.05 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  69.44 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  67.72 
 
 		 261 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  60.96 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  61.66 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  57.25 
 
 		 268 aa  291  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  55.69 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.39 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  54.02 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.22 
 
 		 288 aa  235  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  45.34 
 
 		 261 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  48.95 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  46.94 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.18 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.33 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  44.8 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  47.62 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  47.76 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  49.57 
 
 		 264 aa  225  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  48.55 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  47.9 
 
 		 282 aa  224  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  44.67 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  44.4 
 
 		 271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  46.72 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  50.23 
 
 		 287 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.03 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.17 
 
 		 265 aa  218  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  45.11 
 
 		 281 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  49.77 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  49.77 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  46.41 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  42.91 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  44.8 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  47.21 
 
 		 276 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  46.41 
 
 		 278 aa  214  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  46.64 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  43.72 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  43.9 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  49.52 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.06 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.78 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.03 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.23 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  45.56 
 
 		 284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.81 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.37 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  43.02 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 275 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.35 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  47.71 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.29 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  46.78 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  46.29 
 
 		 263 aa  208  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  44.08 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.57 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 282 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.86 
 
 		 271 aa  207  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.35 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.72 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.19 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  47.92 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.18 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.53 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  45.89 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.22 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  44.31 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  44.98 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  44.98 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  46.03 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  43.21 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.11 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  47.51 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  44.03 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.43 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>