More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3458 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  100 
 
 		 263 aa  547  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  85.93 
 
 		 263 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  85.83 
 
 		 258 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  84.77 
 
 		 261 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  78.85 
 
 		 262 aa  434  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  77.82 
 
 		 272 aa  431  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  77.65 
 
 		 255 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  76.56 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  74.62 
 
 		 278 aa  414  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  75.48 
 
 		 266 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  75.19 
 
 		 265 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  69.26 
 
 		 261 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  70.31 
 
 		 289 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  69.84 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  69.44 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  55.04 
 
 		 278 aa  309  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  61.54 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  58.98 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  57.42 
 
 		 274 aa  291  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  53.12 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.49 
 
 		 330 aa  242  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  46.59 
 
 		 259 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.3 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.56 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  44.58 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.33 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.97 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  45.12 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  47.7 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.6 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.9 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  46.96 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  45.49 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.32 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  42.52 
 
 		 281 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.49 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.34 
 
 		 276 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  43.14 
 
 		 278 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  47.11 
 
 		 264 aa  220  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  44.92 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.49 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  42 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  44.9 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  46.7 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  48.46 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.12 
 
 		 311 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.03 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  43.72 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.89 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.9 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.81 
 
 		 280 aa  214  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  43.6 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.57 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  41.63 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  46.72 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.09 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.65 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  47.86 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  46.98 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  45.75 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.05 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  44.31 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  46.32 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.7 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  46.98 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.18 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.09 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.15 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  43.78 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.25 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  44.03 
 
 		 280 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  43.25 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.21 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.4 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.4 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  45.92 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.69 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.33 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.88 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  46.55 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  44.96 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  44.83 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>