More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1463 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  90.6 
 
 		 266 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  79.62 
 
 		 272 aa  431  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  80 
 
 		 255 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  80.95 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  77.34 
 
 		 263 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  75.19 
 
 		 263 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  75.69 
 
 		 261 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  73.64 
 
 		 262 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  74.31 
 
 		 258 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  68.63 
 
 		 261 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  68.08 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  68.09 
 
 		 289 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  67.86 
 
 		 284 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  67.46 
 
 		 284 aa  350  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  60.15 
 
 		 278 aa  324  7e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  57.79 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  60.62 
 
 		 275 aa  293  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  57.65 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  47.67 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  49.39 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  46.94 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.35 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 291 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.99 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  51.9 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  47.37 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  46.09 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.36 
 
 		 330 aa  224  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  49.59 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  44.84 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.39 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  47.45 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.84 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  44.98 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  45.06 
 
 		 288 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  46.48 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  54.42 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.66 
 
 		 254 aa  214  8e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  49.14 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  45.67 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.6 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  49.1 
 
 		 246 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.45 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  43.92 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.22 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  48.62 
 
 		 287 aa  211  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  42.92 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  44.35 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.4 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.27 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.87 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  43.32 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  44.27 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  47.37 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  47.37 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.96 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.67 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.1 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.87 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  44.49 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  46.69 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.2 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  47.75 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.41 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 282 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.58 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.44 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.26 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  45.61 
 
 		 280 aa  204  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  47.62 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.19 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.31 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.74 
 
 		 275 aa  201  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.73 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  47.77 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.9 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  43.37 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  43.15 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  45.89 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  44.77 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.39 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  48.73 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  43.07 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48 
 
 		 252 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  42.91 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>