More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0426 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  83.9 
 
 		 267 aa  441  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  69.96 
 
 		 270 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  70.3 
 
 		 267 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  69.26 
 
 		 271 aa  351  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  67.42 
 
 		 267 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  67.98 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  57.94 
 
 		 266 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  58.54 
 
 		 267 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  59.09 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  58.3 
 
 		 269 aa  278  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  57.14 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  56 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  56.75 
 
 		 257 aa  268  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  55.78 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  50.61 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  54.8 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.75 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  57.08 
 
 		 252 aa  262  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 		 284 aa  260  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  56.41 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  52.38 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  52.52 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  57.14 
 
 		 246 aa  248  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  49.64 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  57.98 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  49.8 
 
 		 304 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  49.41 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  49.01 
 
 		 306 aa  241  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  46.95 
 
 		 274 aa  225  7e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.27 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  47.18 
 
 		 278 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  51.32 
 
 		 233 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.64 
 
 		 265 aa  215  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 299 aa  214  9e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  48.28 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.38 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.13 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.54 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  47.86 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  43.98 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 		 271 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  47.75 
 
 		 276 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.45 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  47.86 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  47.86 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.81 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.45 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.45 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.7 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.54 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  44.67 
 
 		 278 aa  208  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.6 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.67 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.75 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.4 
 
 		 254 aa  208  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.58 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.62 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  45.67 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  47.5 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  51.83 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  44.66 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  46.69 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  47.26 
 
 		 262 aa  205  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  55.22 
 
 		 284 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.17 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 275 aa  204  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.82 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.96 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  46.56 
 
 		 333 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 272 aa  202  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  44.53 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  43.68 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  54.73 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  45.02 
 
 		 299 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.83 
 
 		 259 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.81 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  43.31 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  46.98 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.8 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  49.12 
 
 		 252 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.15 
 
 		 259 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  48.15 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  45.3 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  44.54 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  48.03 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 261 aa  198  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>