More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  74.9 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  59.05 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  58 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  53.59 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  45.42 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  46.56 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.75 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  46.12 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  44.4 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  47.9 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  45.53 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.21 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.01 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.31 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  47.23 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  46.41 
 
 		 262 aa  205  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  46.35 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.53 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  44.81 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  46.59 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  42.69 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  46.81 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  44.23 
 
 		 284 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  45.77 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  46.64 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  44.54 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  45.27 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  46.22 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  44.7 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  46.5 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  50 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  45.06 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.21 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  46.64 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.25 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.29 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  47.01 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  48.09 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  51.38 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  51.38 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  51.38 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  44.67 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  43.75 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  46.69 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  42.34 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 276 aa  194  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.92 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  41.3 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  46.03 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  44.96 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  50.92 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  44 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  47.3 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  44.68 
 
 		 333 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.22 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  44.66 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.94 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  45.95 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  45.96 
 
 		 265 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  45.96 
 
 		 265 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  45 
 
 		 288 aa  191  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  44.4 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  43.88 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  50.46 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.37 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  49.54 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  46.75 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  40.16 
 
 		 267 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  44.49 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  45.97 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.93 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.21 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  40.85 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  42.74 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 		 281 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  45.56 
 
 		 284 aa  188  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  43.8 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  43.98 
 
 		 241 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  47.39 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  48.58 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  41.94 
 
 		 253 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  44.13 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  40.44 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  44.54 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>