More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4457 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  79.2 
 
 		 265 aa  400  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  77.74 
 
 		 262 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  74.4 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  73.23 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  74.4 
 
 		 266 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  72.8 
 
 		 275 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  73.2 
 
 		 273 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  73.2 
 
 		 273 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  72.8 
 
 		 273 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  68.32 
 
 		 263 aa  351  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  67.68 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  68 
 
 		 263 aa  345  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  72.36 
 
 		 278 aa  337  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  62.79 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  68.8 
 
 		 268 aa  326  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  64.34 
 
 		 263 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  65.69 
 
 		 276 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  66.14 
 
 		 264 aa  321  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  63.02 
 
 		 262 aa  321  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  63.97 
 
 		 270 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  65.49 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  65 
 
 		 263 aa  305  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  65.5 
 
 		 266 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  63.98 
 
 		 265 aa  298  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  65.12 
 
 		 266 aa  298  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0859  ABC transporter related  59.53 
 
 		 258 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0340597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  49.17 
 
 		 262 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.52 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  47.01 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.98 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.35 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.12 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.12 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  47.11 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.41 
 
 		 286 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  49.59 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.25 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  48.67 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48.23 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.98 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  51.33 
 
 		 282 aa  225  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  51.88 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  45.92 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  48.56 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.89 
 
 		 258 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  46.56 
 
 		 278 aa  222  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  48.94 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  48.78 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  44.81 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.09 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  47.37 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.37 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  51.08 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  47.28 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.67 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.63 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  45.9 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.23 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  47.77 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  48.24 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  46.49 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  43.21 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  47.13 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.18 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  46.21 
 
 		 447 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.97 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  46.56 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  47.84 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.28 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  50.43 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.91 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.83 
 
 		 262 aa  215  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  43.55 
 
 		 250 aa  214  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.17 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 		 434 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  48.74 
 
 		 448 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.62 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 438 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  51.77 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.32 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.74 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.23 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  47.52 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.08 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  48.13 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  42.37 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>