More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3551 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 324 aa  661    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  78.44 
 
 		 274 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  78.21 
 
 		 274 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  61.51 
 
 		 267 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  57.77 
 
 		 269 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.49 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  56.64 
 
 		 266 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  54.1 
 
 		 266 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  57.77 
 
 		 271 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  52.16 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  56.28 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  54.44 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  53.78 
 
 		 276 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  56.35 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  53.78 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  54.75 
 
 		 268 aa  263  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  55.95 
 
 		 284 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 282 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  57.03 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  55.42 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  54.44 
 
 		 270 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.44 
 
 		 277 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 284 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  51.63 
 
 		 246 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  53.33 
 
 		 259 aa  242  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  48.67 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  49.19 
 
 		 306 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  49.19 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  50.21 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.56 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  49.63 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  49.57 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  44.35 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  47.41 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  45.42 
 
 		 276 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  44.57 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.54 
 
 		 261 aa  209  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.78 
 
 		 330 aa  208  8e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.03 
 
 		 254 aa  208  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  45.31 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.52 
 
 		 258 aa  208  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.8 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  50.66 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  50.41 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.01 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.64 
 
 		 258 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  44.88 
 
 		 263 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  49.4 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  46.43 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 291 aa  205  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.71 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  55.02 
 
 		 278 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  42.6 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.14 
 
 		 278 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  44.26 
 
 		 244 aa  203  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  43.67 
 
 		 244 aa  203  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.75 
 
 		 253 aa  202  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.35 
 
 		 264 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  41.37 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  49.78 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  46.84 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  47.16 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  49.52 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.89 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  43.67 
 
 		 244 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.23 
 
 		 265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  46.72 
 
 		 261 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49.34 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  43.45 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  43.14 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  44.54 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  44.54 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  41.47 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  50.46 
 
 		 265 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 		 233 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  48.02 
 
 		 281 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 		 271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.52 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  46.09 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.64 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  45.16 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  42.86 
 
 		 275 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 		 256 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 		 281 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.44 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  44.64 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.51 
 
 		 263 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.9 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.06 
 
 		 274 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.53 
 
 		 251 aa  196  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>