More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3211 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 282 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  87.32 
 
 		 284 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  69.17 
 
 		 277 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  60.47 
 
 		 299 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  59.68 
 
 		 304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  59.29 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  58.3 
 
 		 276 aa  278  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  54.26 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  51.85 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  52.36 
 
 		 252 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  55.28 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  55.69 
 
 		 252 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  54.44 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  53.21 
 
 		 266 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.16 
 
 		 324 aa  262  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  51.87 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.56 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  53.23 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  50.56 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  49.64 
 
 		 268 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  51.81 
 
 		 269 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  51.42 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  51.19 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  48.24 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  51.49 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  52.4 
 
 		 257 aa  235  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  51.85 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  51.91 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 275 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  48.76 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 278 aa  217  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  51.06 
 
 		 278 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  48.15 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 		 261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  47.67 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.67 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  45.49 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  45.83 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  46.67 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.16 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.8 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  49.79 
 
 		 333 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  45.25 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.35 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.72 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49.58 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  47.46 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  47.58 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  47.88 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  49.33 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  47.68 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  44.66 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  43.8 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.33 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.12 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  45.42 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  48.77 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  49.36 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  46.47 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.37 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  48.73 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  47.52 
 
 		 265 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  45 
 
 		 274 aa  205  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  47.23 
 
 		 283 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.28 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  43.22 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.08 
 
 		 253 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.38 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  46.77 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.26 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.49 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  46.38 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.93 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.33 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  44.98 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.96 
 
 		 252 aa  202  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  46.5 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  45.99 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.23 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  44.24 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.82 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.34 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.24 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 		 272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  46.44 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>