More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2280 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  60.17 
 
 		 274 aa  271  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  57.43 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  60.18 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  51.87 
 
 		 288 aa  238  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  46.09 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  46.96 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  45.04 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.22 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  45.11 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  47.66 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  48.99 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  43.08 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.45 
 
 		 324 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  42.74 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  47.95 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  42.35 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.19 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  47.98 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  46.55 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  46.29 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 276 aa  205  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  46.56 
 
 		 270 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  45.78 
 
 		 299 aa  204  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  47.91 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  45.78 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  45.78 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.12 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  43.31 
 
 		 278 aa  201  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  44.14 
 
 		 276 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.59 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  43.82 
 
 		 284 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  46.22 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  47.3 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  45.57 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  47.44 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  45.49 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  45 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49.79 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  48.8 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  46.48 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  48.93 
 
 		 289 aa  198  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  54.82 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  43.53 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  47.74 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  44.4 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.06 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  46.15 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  45.06 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  49.36 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  46.3 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  45.92 
 
 		 265 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  45.26 
 
 		 272 aa  194  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.09 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  47.48 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  46.12 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  46.94 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  45.02 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  42.53 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  45.06 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  47.68 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.98 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  46.4 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  50 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4360  ABC transporter related  44.53 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  41.7 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  43.25 
 
 		 439 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  44.14 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  49.04 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.98 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  48.9 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  41.94 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  44.26 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  43.03 
 
 		 436 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.72 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  47.2 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  45.91 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  45.69 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  45.42 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.96 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.05 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  44.9 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.45 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.96 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  42.13 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  43.03 
 
 		 434 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  42.23 
 
 		 436 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>