More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5690 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  69.92 
 
 
276 aa  332  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  66.25 
 
 
273 aa  328  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  65.82 
 
 
299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  58.05 
 
 
255 aa  265  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  51.26 
 
 
265 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  55.88 
 
 
278 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  53.88 
 
 
266 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  59.07 
 
 
330 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.07 
 
 
261 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  53.1 
 
 
264 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  51.03 
 
 
259 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  48.7 
 
 
252 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  59.05 
 
 
291 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  50.9 
 
 
278 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  50.88 
 
 
272 aa  227  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
268 aa  226  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  51.09 
 
 
281 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  49.55 
 
 
258 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  54.05 
 
 
274 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  49.79 
 
 
269 aa  226  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
273 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  49.37 
 
 
261 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  51.77 
 
 
263 aa  222  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  49.38 
 
 
278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  49.78 
 
 
258 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  48.07 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  50.91 
 
 
262 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  49.78 
 
 
278 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  48.46 
 
 
263 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  54.29 
 
 
268 aa  215  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  46.64 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  50.21 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  49.1 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  47.66 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  48.91 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
290 aa  211  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  50.61 
 
 
286 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49.79 
 
 
284 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  51.97 
 
 
275 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.22 
 
 
254 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  49.79 
 
 
284 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  50.45 
 
 
276 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  49.12 
 
 
266 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  50.23 
 
 
271 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.36 
 
 
281 aa  208  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  46.85 
 
 
275 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  52 
 
 
282 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  49.55 
 
 
259 aa  208  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  48.52 
 
 
289 aa  207  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  48.72 
 
 
252 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  48.72 
 
 
252 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  48.47 
 
 
304 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  48.72 
 
 
252 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.53 
 
 
261 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50.89 
 
 
288 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  48.47 
 
 
306 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.29 
 
 
259 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  48.28 
 
 
284 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.36 
 
 
260 aa  207  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  53.27 
 
 
262 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  47.01 
 
 
259 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  48.67 
 
 
299 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  46.61 
 
 
333 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  54.21 
 
 
281 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 
254 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.38 
 
 
281 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.35 
 
 
254 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
256 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  50.66 
 
 
285 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 
275 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.9 
 
 
246 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.76 
 
 
263 aa  205  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  52.47 
 
 
281 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  53.74 
 
 
281 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  53.74 
 
 
281 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.93 
 
 
297 aa  204  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.08 
 
 
253 aa  205  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  48.51 
 
 
271 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 
271 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  50 
 
 
254 aa  204  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.22 
 
 
252 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  47.47 
 
 
254 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  45.3 
 
 
267 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  54.23 
 
 
246 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
281 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  54.46 
 
 
275 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50 
 
 
264 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  52.31 
 
 
278 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  49.55 
 
 
271 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  47.03 
 
 
244 aa  203  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  52.61 
 
 
260 aa  202  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  52.58 
 
 
257 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.37 
 
 
280 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.96 
 
 
254 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.94 
 
 
264 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  51.21 
 
 
292 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.34 
 
 
251 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
278 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  43.11 
 
 
250 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>