More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4164 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  80.54 
 
 		 259 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  67.18 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4360  ABC transporter related  62.96 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  50.21 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  46.92 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  54.29 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  46.67 
 
 		 252 aa  215  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  48.39 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  45.56 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  53.11 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  49.79 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  51.3 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  47.43 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  45.21 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  50.76 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  53.73 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  49.31 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  50.86 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  45.49 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.75 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  46.35 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  44.36 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  43.09 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  45.69 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  47.51 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.35 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  42.97 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  40.96 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  51.58 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.58 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  46.47 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.18 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.98 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  47.76 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  48.9 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  46.09 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  45.16 
 
 		 244 aa  192  6e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.09 
 
 		 260 aa  192  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  41.73 
 
 		 268 aa  191  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.75 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  44.92 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  39.02 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.89 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  43.86 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  40.24 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.05 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  48.68 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  45.78 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  42.41 
 
 		 304 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  47.69 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  45.31 
 
 		 257 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.62 
 
 		 276 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  40.5 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  45.83 
 
 		 287 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.95 
 
 		 330 aa  188  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 		 277 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  42.56 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.95 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  49.29 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  42.46 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.25 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  46.22 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.97 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.08 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  42.49 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  44.78 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  42.52 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  43.81 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  41.76 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.73 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  40.5 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  39.6 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  43.19 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  40 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  44.92 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  47.46 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  46.15 
 
 		 244 aa  186  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  49.78 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  47.22 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  47.22 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  42.98 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  45.93 
 
 		 263 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  49.08 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  42.97 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  47.28 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.58 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>