More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3870 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  100 
 
 
267 aa  550  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  62.41 
 
 
266 aa  338  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  61.09 
 
 
266 aa  322  6e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  58.8 
 
 
274 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  59.93 
 
 
274 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.51 
 
 
324 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58.62 
 
 
276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 
267 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  59.36 
 
 
252 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  58.91 
 
 
276 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  58.75 
 
 
269 aa  291  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  58.33 
 
 
267 aa  291  9e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  53.78 
 
 
252 aa  289  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  54.8 
 
 
261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  58.54 
 
 
268 aa  288  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  58.06 
 
 
271 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  58.59 
 
 
267 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  55.77 
 
 
284 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  55.77 
 
 
270 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  54.72 
 
 
277 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  56.33 
 
 
246 aa  271  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  56.64 
 
 
257 aa  270  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  52.94 
 
 
276 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 
284 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  50.8 
 
 
246 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  48.63 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  48.63 
 
 
306 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  48.82 
 
 
299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  51.38 
 
 
259 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  48.45 
 
 
281 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  47.43 
 
 
268 aa  225  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  47.88 
 
 
274 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.49 
 
 
275 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.05 
 
 
254 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
299 aa  217  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  42.75 
 
 
265 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.05 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  47.56 
 
 
244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 
263 aa  214  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  46.25 
 
 
278 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  44.31 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.05 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  45.93 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  44.4 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  47.33 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  46.27 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.93 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  43.14 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.85 
 
 
258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  42.91 
 
 
278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  48.39 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
278 aa  212  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.16 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  46.96 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  47.23 
 
 
262 aa  211  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  42.51 
 
 
273 aa  211  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.55 
 
 
263 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.08 
 
 
254 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 
254 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  43.8 
 
 
283 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  45.56 
 
 
268 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  46.53 
 
 
254 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  47.73 
 
 
259 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.44 
 
 
274 aa  209  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.12 
 
 
330 aa  208  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.83 
 
 
258 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 
264 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
260 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  46.89 
 
 
284 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  45.99 
 
 
263 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 
255 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  47.11 
 
 
289 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  45.26 
 
 
261 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  43.15 
 
 
255 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  47.11 
 
 
284 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.33 
 
 
304 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.38 
 
 
256 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  47.21 
 
 
263 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  45.89 
 
 
265 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  49.79 
 
 
266 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  46.35 
 
 
276 aa  205  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  44.31 
 
 
255 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 
233 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  45.04 
 
 
244 aa  205  5e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  44.49 
 
 
278 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  46.18 
 
 
259 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  50 
 
 
297 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.03 
 
 
272 aa  205  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.85 
 
 
253 aa  205  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  46.28 
 
 
262 aa  204  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 
253 aa  204  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 
284 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  43.63 
 
 
266 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  42.28 
 
 
254 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.09 
 
 
258 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>