More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0807 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  100 
 
 
269 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.41 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.88 
 
 
252 aa  237  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.64 
 
 
288 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  48.18 
 
 
279 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.61 
 
 
253 aa  236  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  43.3 
 
 
278 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.85 
 
 
269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  44.71 
 
 
255 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  47.77 
 
 
263 aa  228  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  49.55 
 
 
263 aa  228  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
254 aa  226  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  45.17 
 
 
259 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  46.84 
 
 
275 aa  224  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.56 
 
 
259 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  42.97 
 
 
272 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  45.42 
 
 
295 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.21 
 
 
286 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.05 
 
 
253 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.04 
 
 
260 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  42.59 
 
 
272 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.58 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
261 aa  222  6e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.39 
 
 
274 aa  221  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 
271 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.17 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  44.35 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47.58 
 
 
289 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  44.14 
 
 
265 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  42.91 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.18 
 
 
272 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  43.75 
 
 
265 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  43.75 
 
 
265 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  43.75 
 
 
271 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
267 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.83 
 
 
259 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
265 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  47.28 
 
 
287 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
261 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  43.75 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.24 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.63 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.5 
 
 
252 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  45.8 
 
 
273 aa  216  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  46.43 
 
 
271 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.35 
 
 
286 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  41.83 
 
 
279 aa  215  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.4 
 
 
260 aa  215  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.43 
 
 
254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  42.58 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 
281 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  45.72 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  43.36 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  46.35 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  45.31 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  42.97 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.76 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  44.12 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.13 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.97 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  42.58 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  43.2 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.44 
 
 
279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  46.09 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  44.13 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.27 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  45.6 
 
 
293 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  45.24 
 
 
259 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  45.6 
 
 
293 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  44.27 
 
 
275 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  43.19 
 
 
272 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.88 
 
 
259 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  42.8 
 
 
292 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.4 
 
 
297 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.53 
 
 
267 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  44.14 
 
 
264 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
258 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 
273 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  47.79 
 
 
269 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  42.15 
 
 
271 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  46.69 
 
 
268 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 
281 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  41.22 
 
 
285 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  46.22 
 
 
259 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0455  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.52 
 
 
287 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.94 
 
 
267 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>