More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3009 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  64.08 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  66.12 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  63.64 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  63.52 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.98 
 
 		 245 aa  307  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  60.49 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  60.49 
 
 		 259 aa  304  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  60.08 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  59.67 
 
 		 259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  59.84 
 
 		 252 aa  298  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  59.26 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.9 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.16 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.95 
 
 		 271 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  49.37 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  48.54 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.5 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.94 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  45.41 
 
 		 247 aa  214  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  49.08 
 
 		 246 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  48.05 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45.31 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  46.28 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  45.38 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  49.8 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  45.97 
 
 		 262 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  48.89 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 251 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  49.17 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.28 
 
 		 272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.18 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.7 
 
 		 283 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  48.95 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  43.15 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  46.59 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  47.11 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  47.9 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  46.72 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.67 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  46.03 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.82 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.2 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  48.09 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  48.09 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  50.88 
 
 		 267 aa  208  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  49.56 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.32 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  53.37 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  45.71 
 
 		 281 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  45.71 
 
 		 281 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  47.32 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  45.53 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  46.19 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.81 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  47.79 
 
 		 281 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.58 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  42.26 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  47.7 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.67 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.89 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  49.77 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  47.39 
 
 		 285 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  49.34 
 
 		 278 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  45.15 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  48.19 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  49.57 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.23 
 
 		 253 aa  204  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  46.43 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  45.87 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.83 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  50.44 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  43.4 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.43 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.17 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.32 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  48.43 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.43 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  48.43 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  47.19 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  50.44 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>